中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性
文献类型:期刊论文
作者 | 向闱1,2; 宁祖林3; 康明2,3; 黄宏文3 |
刊名 | 热带亚热带植物学报
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出版日期 | 2010 |
卷号 | 18期号:06页码:665-669 |
关键词 | 中国板栗 EST-SSR 栗属 通用性 |
英文摘要 | 从已公布的壳斗科(Fagaceae)基因组数据库中获得 48501条中国板栗 (Castaneamollissima)EST序列, 其中8479条 EST含有 12116个长度大于 10bp的 SSR, EST-SSR的出现频率为 24.98%。 二核苷酸重复和三核苷酸重复是中国板栗 EST-SSR最主要的重复类型, 分别占总数的 38.05%和 42.20%。 对中国板栗 EST-SSR标记在茅栗(C.seguinii)和锥栗(C.henryi)上的通用性检测表明, 677对中国板栗 EST-SSR引物皆能扩增, 证实这些引物在栗属中国特有种间具有很高的通用性。 115个位点的多态性分析表明, 中国板栗、茅栗和锥栗分别有 106、108和 101个位点表现出多态性。 在 575个等位基因中, 有 260(45.22%)是 3物种的共有等位基因, 各物种都有各自特有的等位基因。 这项研究为中国栗属植物 EST-SSR标记的建立及应用奠定了基础 |
源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/3661] ![]() |
专题 | 研究领域 |
作者单位 | 1.中国科学院研究生院,北京 100049; 2.中国科学院武汉植物园,武汉430074; 3.中国科学院华南植物园,广州 510650 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 向闱,宁祖林,康明,等. 中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性[J]. 热带亚热带植物学报,2010,18(06):665-669. |
APA | 向闱,宁祖林,康明,&黄宏文.(2010).中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性.热带亚热带植物学报,18(06),665-669. |
MLA | 向闱,et al."中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性".热带亚热带植物学报 18.06(2010):665-669. |
入库方式: OAI收割
来源:华南植物园
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