环境选择压会促使群体的进化。相比于光合作用的自养植物，非光合作用植物从40支独立进化，在弱光条件下演化出独特的进化模式。为，了研究其中的分子进化机理，我们组装并解析了天麻基因组，也即迄今为止第一个非光合作用植物基因组。天麻在形态上出现了严重的根部退化和叶片的退化，在分子水平上，核基因组以及残留的叶绿体基因相关的光合作用基因出现了明显的选择放松信号，同时，在光合作用系统、叶片生长、质体分裂等方面也存在基因的缺失；天麻为了适应于真菌共生的独特模式，整个代谢通路进行了巨大重组，在碳代谢、氮代谢、生物节律、线粒体能量代谢、开花调控等方面都发生了不同程度的调控变化。天麻基因组不仅为我们揭示了非光合作用植物独特的进化模式，也为我们提供了一个新的真菌共生的研究模型。此外，天麻同时也是一种药用植物。目前，世界上50%的化药最初来源于植物。目前，合成生物学可以将植物中的相关合成基因导入到细菌中，合成目的化合物，多组学结合、上游数据与下游产业化结合发展成为当下药用植物研究趋势。而随着测序技术的发展和测序成本的降低，越来越多的研究者开始进行药用植物基因组学研究，近几年出现了不少数据“撞车”现象。因此，药用植物基因组亟待一个公共数据平台，为相关研究者提供信息全面的组学数据信息，达成数据实时共享与共赢合作，避免不必要的恶性竞争。在博士学习期间，我也负责搭建了全球第一个药用植物组学数据库（Herbal Medicine Omics Database， http://herbalplant.ynau.edu.cn/），涵盖了目前为止已发表的基因组、转录组、代谢组以及代谢通路数据初步实现百种中草药数据的共享、利用，满足有效成分合成生物学对关键合成酶的查找、定位功能，极大地促进相关研究工作效率的提升，实现数据纵向系统贯穿、横向分享分析，达到提高药用植物研究交流水平和数据共享的目的。