马氏珠母贝群体遗传结构分析和基因型育种初探
文献类型：学位论文
| 作者 | 黄景 |
| 答辩日期 | 2019 |
| 授予单位 | 南海海洋研究所 |
| 导师 | 何毛贤 |
| 关键词 | 马氏珠母贝，遗传结构，基因型育种，SNP，形态学 |
| 学位名称 | 硕士 |
| 学位专业 | 海洋生物学 |
| 其他题名 | Analysis of Population Genetic Structure and Genotype Breeding for Pinctada fucata martensii |
| 英文摘要 | 遗传结构是生物增养殖、种质创制和品种培育的重要基础。在中国目前的养殖生产中，马氏珠母贝的种苗来源、种质还极为混杂，通过形态学和分子标记等对马氏珠母贝养殖群体的遗传多样性和遗传结构进行评估与剖析，将有助于养殖管理和育种策略的制定；而发展分子标记辅助育种实现基因型选择将提升育种效率。该文以25个SNP分子标记并结合形态标记，对4个马氏珠母贝中国养殖群体的遗传结构进行探究；然后挑选出显著差异的4个SNP位点，利用HRM法对亲本和F1基因型进行分型，分析亲本和F1的遗传结构差异；同时利用已鉴定与生长关联的1个SNP位点构建不同基因型组配，探究马氏珠母贝基因型育种效应。研究结果如下：1. 马氏珠母贝4个养殖群体形态判别率为75.6%，海南群体和杂交贝群体形态特征相似。杂交贝群体、深圳群体、海南群体和湛江群体的平均观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为0.2734、0.2504、0.2236和0.2531， 0.2870、0.2807、0.2636和0.2374；平均多态性信息含量分别为0.2272、0.2230、0.2119、0.1923。杂交贝群体和海南群体间基因流动较为频繁，Nm值为6.0928，而深圳群体和其他3个群体间的基因流动较少。聚类分析、遗传距离分析和基因流分析结果表明，海南群体和杂交贝群体的遗传结构相似，可作为一个群体进行管理；湛江群体和杂交贝群体可能存在共同亲本来源，而深圳群体是1个较独立的群体。2. 杂交子代F1与母本（深圳群体）的形态差异最小，父本（海南群体）与母本、F1的形态差异较大。采用HRM法应用4个SNP位点对这3个群体进行分型，3个群体的平均观测杂合度Ho 和 期望杂合度He分别为0.2110～0.2879，0.3317～0.4685，F1的杂合度高于两个亲本；平均多态信息含量PIC值为0.2643～0.3556，呈现中等程度遗传多样性。F1与母本之间的基因流Nm最大（7.7701），遗传距离最小（0.0546），亲缘关系最近；两个亲本之间的Nm最小（1.9662），遗传距离最大（0.1759）。SNP位点rs8的基因型频率在两个亲本间差异明显，可作为亲本群体间的特异性标记。3. ASSN1184的TT基因型在两个群体中都为优势基因型，与预测的结果一致；TT的基因型效应在群体1中为1.82%~7.21%，在群体2中为2.41%~7.25%。该标记可用作育种亲本的选择标记。 |
| 源URL | [http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/18102]  |
| 专题 | 南海海洋研究所_学位论文（硕士） |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 黄景. 马氏珠母贝群体遗传结构分析和基因型育种初探[D]. 南海海洋研究所. 2019. |
入库方式： OAI收割
来源：南海海洋研究所
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