基于转录组分析红耳龟盐度适应的离子调节
文献类型：期刊论文
| 作者 | 洪美玲1; 李江月1; 江爱萍1; 丁利1; 史海涛1,2 |
| 刊名 | 基因组学与应用生物学
 |
| 出版日期 | 2018 |
| 卷号 | 37期号:10页码:4297-4306 |
| ISSN号 | 1674-568X |
| 关键词 | 盐度适应 红耳龟 离子调节 转录组学 |
| DOI | 10.13417/j.gab.037.004297 |
| 其他题名 | Salinity Adaptation in Ions Adjustments of the Red-eared Slider Turtle Using Liver Transcriptomic Data |
| 产权排序 | 2 |
| 文献子类 | Article |
| 英文摘要 | 外来有害入侵物种红耳龟(Trachemys scripta elegans),原属于淡水龟类,但目前研究发现其可存活于半咸水环境中,这使得未来红耳龟可入侵的潜在范围及危害将增大。为了探究红耳龟对盐度适应的分子机制,本研究应用高通量转录组测序技术,分析其在不同盐度环境中参与离子调节的主要基因及通路。我们设计了三个处理组:对照组(自来水)、低盐度组(0.5%,即盐度5组)和高盐度组(1.5%,即盐度15组),慢性胁迫8周后,分析血液中无机离子、葡萄糖及皮质醇含量,并对其肝脏转录组数据进行分析。结果表明,与对照组相比,盐度5组血液渗透压、[Na+]和血糖差异不显著(p>0.05),而盐度15组显著升高;血液[Cl-]三组间差异均显著;两个盐度处理组血液[K+]显著低于对照组(p<0.05);但血液皮质醇含量在三组之间差异均不显著。 GO (Gene ontology)富集分析发现,参与离子调节的基因主要有电压门控钾通道亚家族5 (KCNH5)、电压门控钠通道I (SCN1B)、利尿肽前体A (NPPA)、ATP酶(ATPeFOA, MTATP6, ATP6)、葡萄糖激酶(GCK)、盐诱导激酶(SIK)、脂联素(ACDC)和类固醇17alpha-单氧酶(CYP17A)等。所筛选出的基因大多被富集到与能量代谢、脂肪代谢、碳水化合物代谢以及内分泌系统等KEGG通路类别中。综上所述,红耳龟在盐度适应过程中参与离子调节的大部分KEGG通路以及相关的生理指标均未发生显著变化,说明它能较好地适应慢性低盐度胁迫(盐度0.5%左右)。 |
| URL标识 | 查看原文 |
| WOS研究方向 | Zoology (provided by Clarivate Analytics) |
| 语种 | 中文 |
| CSCD记录号 | CSCD:6363918 |
| 源URL | [http://210.75.237.14/handle/351003/30423]  |
| 专题 | 食品安全与环境治理领域_中国科学院环境与应用微生物重点实验室 |
| 通讯作者 | 丁利 |
| 作者单位 | 1.海南师范大学生命科学学院, 海口,571158; 2.中国科学院成都生物研究所,成都,610041 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 洪美玲,李江月,江爱萍,等. 基于转录组分析红耳龟盐度适应的离子调节[J]. 基因组学与应用生物学,2018,37(10):4297-4306. |
| APA | 洪美玲,李江月,江爱萍,丁利,&史海涛.(2018).基于转录组分析红耳龟盐度适应的离子调节.基因组学与应用生物学,37(10),4297-4306. |
| MLA | 洪美玲,et al."基于转录组分析红耳龟盐度适应的离子调节".基因组学与应用生物学 37.10(2018):4297-4306. |
入库方式： OAI收割
来源：成都生物研究所
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