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星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析

文献类型:期刊论文

作者郭亚静; 付乾堂; 胡晓笛; 陈茂盛; 潘帮珍; 陶彦彬; 何惠英; 徐增富
刊名分子植物育种
出版日期2020
卷号18期号:12页码:3907-3915
关键词星油藤(Plukenetia volubilis) WOX基因家族 生物信息学分析 表达分析
ISSN号1672-416X
英文摘要

本研究利用星油藤(Plukenetia volubilis L.)转录组及基因组数据库,通过本地BLAST,筛选到了9个星油藤WOX (PvoWOX)基因家族成员,并对它们编码的蛋白质氨基酸序列、分子量和等电点等进行了预测。通过构建系统进化树,将该基因家族成员分为3个进化支,分别为远古支、中间支和WUS支;进一步对PvoWOX家族成员的基因结构和蛋白保守结构域分析发现在同一进化支中均很保守,并且家族成员均含有保守的同源异型结构域,其中WUS支的成员都含有WUS-box结构域。利用转录组数据和qRT-PCR对PvoWOX基因家族成员在星油藤不同器官中的表达谱进行了分析,结果显示9个PvoWOX基因成员具有不同的表达模式,其中WUS支和中间支成员的表达具有组织特异性,而远古支成员则在不同的器官中均有表达。因此推测PvoWOX家族成员具有功能多样性,分别参与调控星油藤不同器官的发育过程。本研究结果为进一步研究PvoWOX的生物学功能提供了帮助。

学科主题Agriculture (Provided By Clarivate Analytics)
语种中文
CSCD记录号CSCD:6743338
源URL[http://ir.xtbg.org.cn/handle/353005/11830]  
专题西双版纳热带植物园_能源植物分子育种研究组
作者单位1.徐增富, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
2.何惠英, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
3.陶彦彬, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
4.潘帮珍, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
5.陈茂盛, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
6.胡晓笛, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
7.付乾堂, 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院, 中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室, 勐腊, 云南 666303, 中国.
8.100049.
9.北京 666303
10.,
推荐引用方式
GB/T 7714
郭亚静,付乾堂,胡晓笛,等. 星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析[J]. 分子植物育种,2020,18(12):3907-3915.
APA 郭亚静.,付乾堂.,胡晓笛.,陈茂盛.,潘帮珍.,...&徐增富.(2020).星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析.分子植物育种,18(12),3907-3915.
MLA 郭亚静,et al."星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析".分子植物育种 18.12(2020):3907-3915.

入库方式: OAI收割

来源:西双版纳热带植物园

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