相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究
文献类型：期刊论文
| 作者 | 赵辉5; 李启寨6; 李俊2; 曾长青3; 胡松年4; 于军1 |
| 刊名 | 中国科学C辑:生命科学
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| 出版日期 | 2006 |
| 页码 | 1-8 |
| 关键词 | 点突变 单碱基多态性 替换 替换偏差 转换 颠换 |
| ISSN号 | 1006-9259 |
| 英文摘要 | 碱基替换突变是形成物种多态性和造成生物进化的根本原因之一.近年的研究表明:基因组的碱基组分在不同程度上与碱基替换突变的发生相关.以水稻全基因组3611007个SNPs(包括45462个编码区SNPs和242811个内含子区SNPs)和拟南芥全基因组32019个SNPs为研究对象,研究突变位点周围的碱基A&T(A和T)的使用频率和点突变类型的相关性,结果表明:水稻和拟南芥全基因组上转换和颠换的比值(Ts/Tv)以及紧邻突变位点(上下游各1个碱基)上A&T碱基的个数负相关.统计了6种SNP的AT2(直接相邻的碱基是A或T的个数)和AT0(直接相邻碱基是C或G的个数),发现水稻和拟南芥都是C/G型SNP的AT2/AT0值最大,说明C/G型SNP可能受直接临近区域上A&T碱基的影响最大.在水稻全基因组SNPs中,A&T碱基影响突变的范围局限在突变位点上下游2个碱基内.拟南芥A&T碱基影响其全基因组SNPs的范围不超过上下游4个碱基. |
| 语种 | 中文 |
| CSCD记录号 | CSCD:2710017 |
| 源URL | [http://ir.amss.ac.cn/handle/2S8OKBNM/56901]  |
| 专题 | 中国科学院数学与系统科学研究院 |
| 作者单位 | 1.华中科技大学 2.安徽医科大学 3.福建省省立医院 4.中国科学院北京基因组研究所 5.黑龙江大学 6.中国科学院数学与系统科学研究院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 赵辉,李启寨,李俊,等. 相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究[J]. 中国科学C辑:生命科学,2006:1-8. |
| APA | 赵辉,李启寨,李俊,曾长青,胡松年,&于军.(2006).相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究.中国科学C辑:生命科学,1-8. |
| MLA | 赵辉,et al."相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究".中国科学C辑:生命科学 (2006):1-8. |
入库方式： OAI收割
来源：数学与系统科学研究院
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