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基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测

文献类型:期刊论文

作者葛志磊 ; 裴昊 ; 王丽华 ; 宋世平 ; 樊春海
刊名中国科学:化学
出版日期2011
期号10页码:1666
关键词金电极 四面体 DNA纳米结构 单碱基多态性
ISSN号1674-7224
中文摘要单碱基多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)一直以来被认为可以作为疾病诊断的有效标记,所以这方面的研究一直备受关注.现有的检测方法多在均相体系中进行.相比较而言,在界面上如果能方便快捷地区分SNP,此方法在医疗检测方面的应用性就可以大为加强.我们成功地利用DNA自组装技术在金电极表面组装了四面体结构的DNA纳米结构探针(tetrahedron structure probes,TSPs),有效地控制界面上DNA组装的密度,使得基于四面体结构的DNA探针的杂交行为更接近于溶液相体系,进而实现了在原有界面上受限于异相反应而无法较好完成的SNP分型检测.在TSP和作为信号分子的reporter DNA之间只有6个互补配对碱基的条件下,就可以得到大于10倍的信噪比.相对地,在传统的单链DNA组装上6个碱基的作用力不足以实现良好的信噪比.同时,基于TSP的金电极组装模式由于较厚的四面体组装层所得到的有效空间,更利于DNA杂交反应以及复杂结构的形成.我们使用了Y-支状的DNA杂交策略分别在TSP和单链上做了对比,发现TSP能非常好地区分SNP,而传统单链上在Y-支状DNA杂交策略的条件下区分度就非常有限.这两点都充分地体现了TSP更接近于溶液相体系的优越性,这种三维DNA探针的优越性为我们研究和应用DNA纳米技术在界面反应提供了新的可能.
收录类别CNKI
语种中文
公开日期2013-09-11
源URL[http://ir.sinap.ac.cn/handle/331007/12571]  
专题上海应用物理研究所_中科院上海应用物理研究所2011-2017年
推荐引用方式
GB/T 7714
葛志磊,裴昊,王丽华,等. 基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测[J]. 中国科学:化学,2011(10):1666.
APA 葛志磊,裴昊,王丽华,宋世平,&樊春海.(2011).基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测.中国科学:化学(10),1666.
MLA 葛志磊,et al."基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测".中国科学:化学 .10(2011):1666.

入库方式: OAI收割

来源:上海应用物理研究所

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