正交信号校正在正常成人血清^1H NMR谱的代谢组分析中的滤噪作用评价
文献类型：期刊论文
| 作者 | 冒海蕾3; 徐旻2; 王斌1; 王惠民1; 邓小明3; 林东海2 |
| 刊名 | 化学学报
 |
| 出版日期 | 2007 |
| 卷号 | 65.0期号:002页码:152 |
| 关键词 | NMR 代谢组学 模式识别 正交信号校正 血清 |
| ISSN号 | 0567-7351 |
| 英文摘要 | 观察、比较正交信号校正（OSC）滤噪前后，用不同的模式识别方法对正常成人血清代谢组^1H NMR谱进行分析的效果，以探讨NMR代谢组学技术应用于临床研究和疾病早期诊断的可行性．78例正常成人在采血前按常规要求禁食8h．记录血清一维600MHz氢谱后，分别采用主成分分析（PCA）、偏最小二乘法判别分析（PLS-DA）以及簇类的独立软模式法（SIMCA）对氢谱进行模式识别分析．结果表明：虽然采血前并无其它诸如饮食、生活方式、生理周期等方面的严格限制，采用OSC滤噪后，PLS-DA能够完全区分不同性别的血清氢谱，其判别能力优于PCA和SIMCA．而且采用OSC滤噪与文献报道的未经OSC处理的PLS-DA法获得的与性别分类有关的主要NMR积分区段基本相同．从OSC去除不同数目的隐变量后所致的PLS-DA模型的性能改变可见：OSC去除两个隐变量时，前两个隐变量的特征值明显比后面的大；剩余残差为20．82％，即去除了79．18％的X变量中与反应变量Y不相关的系统变异．此时PLS-DA计算所得的隐变量个数为1：而不使用OSC或用OSC去除一个隐变量时．PLS-DA所得的隐变量个数分别为3和2．作为PLS-DA模型质量的评价指标．R2X表示PLS-DA模型计算所获得的隐变量反映自变量X的变异的百分比，R2Y则表示隐变量反映因变量Y的变异的百分比，Q2（cure）为交叉验证后PLS-DA模型所获隐变量能够预测X和Y变异的累计百分比．R2X在OSC去除两个隐变量时达到最低值，表明此时PLS-DA计算模型包含的系统变异最少：R2Y与Q2（cum）都达到80％以上并趋于稳定，说明OSC去除两个隐变量时PLS-DA模型的质量优良．显然，OSC可去除饮食、环境等因素的影响，降低临床样本的不均一性．这对于NMR代谢组学技术应用于临床研究至关重要．OSC滤噪去除的隐变量个数应根据剩余残差、去除隐变量的特征值大小、PLS-DA模型计算所得的隐变量个数和反映模型质量的相关指标加以判断． |
| 语种 | 英语 |
| 源URL | [http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/294263]  |
| 专题 | 中国科学院上海药物研究所 |
| 作者单位 | 1.南通大学 2.中国科学院上海药物研究所 3.第二军医大学 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 冒海蕾,徐旻,王斌,等. 正交信号校正在正常成人血清^1H NMR谱的代谢组分析中的滤噪作用评价[J]. 化学学报,2007,65.0(002):152. |
| APA | 冒海蕾,徐旻,王斌,王惠民,邓小明,&林东海.(2007).正交信号校正在正常成人血清^1H NMR谱的代谢组分析中的滤噪作用评价.化学学报,65.0(002),152. |
| MLA | 冒海蕾,et al."正交信号校正在正常成人血清^1H NMR谱的代谢组分析中的滤噪作用评价".化学学报 65.0.002(2007):152. |
入库方式： OAI收割
来源：上海药物研究所
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