中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性
文献类型:期刊论文
作者 | 向闱2; 宁祖林1; 康明2; 黄宏文1 |
刊名 | 热带亚热带植物学报
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出版日期 | 2010 |
卷号 | 018期号:006页码:665 |
ISSN号 | 1005-3395 |
英文摘要 | 从已公布的壳斗科(Fagaceae)基因组数据库中获得48501条中国板栗(Castanea mollissima)EST序列,其中8479条EST含有12116个长度大于10 bp的SSR,EST-SSR的出现频率为24.98%。二核苷酸重复和三核苷酸重复是中国板栗EST-SSR最主要的重复类型,分别占总数的38.05%和42.20%。对中国板栗EST-SSR标记在茅栗(C.seguinii)和锥栗(C.henryi)上的通用性检测表明,677对中国板栗EST-SSR引物皆能扩增,证实这些引物在栗属中国特有种间具有很高的通用性。115个位点的多态性分析表明,中国板栗、茅栗和锥栗分别有106、108和101个位点表现出多态性。在575个等位基因中,有260个(45.22%)是3物种的共有等位基因,各物种都有各自特有的等位基因。这项研究为中国栗属植物EST-SSR标记的建立及应用奠定了基础。 |
语种 | 英语 |
源URL | [http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/9484] ![]() |
专题 | 中国科学院武汉植物园 |
作者单位 | 1.中国科学院华南植物园 2.中国科学院武汉植物园 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 向闱,宁祖林,康明,等. 中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性[J]. 热带亚热带植物学报,2010,018(006):665. |
APA | 向闱,宁祖林,康明,&黄宏文.(2010).中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性.热带亚热带植物学报,018(006),665. |
MLA | 向闱,et al."中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性".热带亚热带植物学报 018.006(2010):665. |
入库方式: OAI收割
来源:武汉植物园
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