CVNH结构域的进化分析和选择压力检测
文献类型：期刊论文
| 作者 | 齐小琼1; 高磊1; 苏应娟2; 王艇1 |
| 刊名 | 遗传
 |
| 出版日期 | 2010 |
| 卷号 | 000期号:001页码:87 |
| 关键词 | CVNH 蓝藻抗病毒蛋白-N 基因复制 净化选择 适应性进化 |
| ISSN号 | 0253-9772 |
| 英文摘要 | 蓝藻抗病毒蛋白-N（Cyanovirin-N,CV-N）具有广谱抗病毒活性,其同源物构成CVNH（Cyanovirin-N homology）蛋白家族,并且家族成员的抗人类免疫缺陷病毒结构域在进化上非常保守。文章通过重建基因树对CVNH结构域的＂零散分布＂特点作了更为细致的了解,发现在黑曲霉、费氏曲菌、产黄青霉、粗糙脉孢霉、蓝杆藻和水蕨等物种中存在多份该结构域拷贝。在此基础上,分别采用机理式模型（Mechanistic model）和MEC模型（Mechanistic-empirical combination model）对CVNH结构域序列位点进行适应性进化分析,结果显示：1）两类模型均未检测到统计上显著的正选择位点;2）净化选择对CVNH起主导作用;3）MEC模型更适合所研究的数据。进一步使用＂支-特异＂模型和＂支-位点＂模型对蓝杆菌菌株7822和7424的祖先分支进行检测,发现该分支经历过适应性进化,并且鉴定出6个正选择位点（34L、63L、13H、76C、78K和80I）。 |
| 语种 | 英语 |
| 源URL | [http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/11236]  |
| 专题 | 中国科学院武汉植物园 |
| 作者单位 | 1.中国科学院武汉植物园 2.中国科学院武汉植物园 3.中山大学生命科学学院 4.中国科学院武汉植物园 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 齐小琼,高磊,苏应娟,等. CVNH结构域的进化分析和选择压力检测[J]. 遗传,2010,000(001):87. |
| APA | 齐小琼,高磊,苏应娟,&王艇.(2010).CVNH结构域的进化分析和选择压力检测.遗传,000(001),87. |
| MLA | 齐小琼,et al."CVNH结构域的进化分析和选择压力检测".遗传 000.001(2010):87. |
入库方式： OAI收割
来源：武汉植物园
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