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广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析

文献类型:期刊论文

作者欧阳蒲月1; 刘永亮3; 王瑛2; 严振1
刊名热带作物学报
出版日期2014
卷号035期号:004页码:746
ISSN号1000-2561
英文摘要为了解广藿香对淀粉的利用.克隆了广藿香(Pogostemoncablin)的α-淀粉酶(alpha—amylase,AMY)基因,对其进行相关生物信息学分析。搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库.获得AMY基因全长序列.并设计全长引物进行PCR验证:利用生物信息学软件对AMY基因进行生物信息学分析。本研究获得的广藿香AMy基因命名为尸cAMY1基因(GenBank登录号为KC862311).该基因全长1420bp,编码422个氨基酸。基于生物信息软件分析了PeAMY1基因编码蛋白的理化特性。系统进化树分析结果表明.PeAMY1基因与牵牛(Ipomoea nil)的AMY序列同源性最高,与赤豆(Vinangularis)、菜豆(haseolusvulgaris)、蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)等植物次之,与自然进化关系保持一致。PcAMY1基因在广藿香嫩茎、成熟茎、老茎、嫩叶、成熟叶、老叶中均有表达,但在老茎中表达量最高。成功克隆到广藿香PeAMY1基因,并对其进行相关生物信息学与基因表达分析。
语种英语
源URL[http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/12134]  
专题中国科学院武汉植物园
作者单位1.广东食品药品职业学院
2.中国科学院华南植物园
3.中国科学院武汉植物园
推荐引用方式
GB/T 7714
欧阳蒲月,刘永亮,王瑛,等. 广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析[J]. 热带作物学报,2014,035(004):746.
APA 欧阳蒲月,刘永亮,王瑛,&严振.(2014).广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析.热带作物学报,035(004),746.
MLA 欧阳蒲月,et al."广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析".热带作物学报 035.004(2014):746.

入库方式: OAI收割

来源:武汉植物园

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