基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记
文献类型：期刊论文
| 作者 | 戚维聪2; 程计华1; 黄邦全3; 李坦2; 林峰2 |
| 刊名 | 江苏农业学报
 |
| 出版日期 | 2014 |
| 卷号 | 030期号:005页码:997 |
| ISSN号 | 1000-4440 |
| 英文摘要 | 利用油料作物海甘蓝（十字花科）发育时期种子的RNA-Seq测序数据组装获得186778条cDNA重叠群（ Contigs）序列，通过MISA 和Primer 3程序设计了6639个EST-SSR分子标记。在这些标记中，除了单核苷酸重复（45%）外，三核苷酸重复的 SSR 是最常见的碱基重复类型（29%），其次是双核苷酸型（10%）、五核苷酸型（7%）、六核苷酸型（5%）和四核苷酸型（2%）型。采用电子定位的方法将1206个EST-SSR标记定位到近缘种白菜（ Brassica napa）的基因组上。依据引物在白菜基因组中的分布，挑选了20条EST-SSR引物在海甘蓝中进行PCR验证，其结果显示所有引物均能够扩增出符合预期大小的PCR片段。这些新开发的EST-SSR引物可以作为功能标记应用于海甘蓝的分类鉴定、遗传图谱构建、种质资源鉴定以及分子标记辅助育种工作中。 |
| 语种 | 英语 |
| 源URL | [http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/13398]  |
| 专题 | 中国科学院武汉植物园 |
| 作者单位 | 1.中国科学院武汉植物园 2.江苏省农业科学院农业生物技术研究所 3.湖北大学 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 戚维聪,程计华,黄邦全,等. 基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记[J]. 江苏农业学报,2014,030(005):997. |
| APA | 戚维聪,程计华,黄邦全,李坦,&林峰.(2014).基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记.江苏农业学报,030(005),997. |
| MLA | 戚维聪,et al."基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记".江苏农业学报 030.005(2014):997. |
入库方式： OAI收割
来源：武汉植物园
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