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猕猴桃EPIC 标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用

文献类型:期刊论文

作者刘磊2; 姚小洪2; 黄宏文3
刊名园艺学报
出版日期2013
卷号40期号:6页码:1162
关键词猕猴桃属 EPIC 标记 跨种扩增 系统发育
ISSN号0513-353X
英文摘要采用生物信息学方法通过比较ESTs数据和基因组数据开发了猕猴桃的双亲遗传单拷贝的EPIC标记以用于猕猴桃属植物系统发育研究。通过比较中华猕猴桃(Actinidia chinensis)和美味猕猴桃(A.deliciosa)的ESTs数据和葡萄(Vitis vinifera)基因组数据,以一致性85%为标准共检测到129个EPIC标记,并从中设计96对引物。其中21对EPIC引物在中华猕猴桃和美味猕猴桃两个商业化栽培品种中呈现稳定扩增,核酸多态性(Pi)为0.003~0.069,变异位点为0.7%~14.8%,简约性信息位点为0~9.4%。用其中的EPIC-1标记重建中华猕猴桃、美味猕猴桃、毛花猕猴桃(A.eriantha)、绵毛猕猴桃(A.fulvicoma var.lanata)和金花猕猴桃(A.chrysantha)的系统发育关系,显示其跨种间扩增的实用性并获得分辨率较高的系统发育树。本研究中开发的EPIC标记可以作为通用引物用于猕猴桃属植物系统发育分析。
语种英语
源URL[http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/15908]  
专题中国科学院武汉植物园
作者单位1.中国科学院华南植物园
2.中国科学院武汉植物园
3.中国科学院武汉植物园
推荐引用方式
GB/T 7714
刘磊,姚小洪,黄宏文. 猕猴桃EPIC 标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用[J]. 园艺学报,2013,40(6):1162.
APA 刘磊,姚小洪,&黄宏文.(2013).猕猴桃EPIC 标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用.园艺学报,40(6),1162.
MLA 刘磊,et al."猕猴桃EPIC 标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用".园艺学报 40.6(2013):1162.

入库方式: OAI收割

来源:武汉植物园

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