苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆
文献类型:期刊论文
作者 | 张晓辉5; 魏小春5; 李锡香5; 孙玉燕5; 王冠5; 常兆晶5; 刘冠群5; 邱杨5; 宋江萍5; 王海平5 |
刊名 | 园艺学报
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出版日期 | 2014 |
卷号 | 41期号:2页码:215 |
关键词 | 苹果 SBP-box 家族 分子进化 基因克隆 |
ISSN号 | 0513-353X |
英文摘要 | 从金冠苹果基因组中鉴定出33个SBP-box家族基因,其中20个为miR156的靶基因。通过进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测。大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现。在富士苹果中克隆了4个代表性成员基因,即MdSPL2、MdSPL11、MdSPL13和MdSPL33;与金冠相比,MdSPL33是一个缺失第2和3外显子的剪切本,并具有2个单碱基变异;MdSPL11和MdSPL13分别存在4个和2个单碱基变异,造成3个和1个氨基酸改变。进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测。大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现。在富士苹果中克隆了4个代表性成员基因,即MdSPL2、MdSPL11、MdSPL13和MdSPL33;与金冠相比,MdSPL33是一个缺失第2和3外显子的剪切本,并具有2个单碱基变异;MdSPL11和MdSPL13分别存在4个和2个单碱基变异,造成3个和1个氨基酸改变。 |
语种 | 英语 |
源URL | [http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/16096] ![]() |
专题 | 中国科学院武汉植物园 |
作者单位 | 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 2.中国农业科学院果树研究所 3.中国科学院武汉植物园 4.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 5.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 6.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 7.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 8.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 9.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 10.中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 张晓辉,魏小春,李锡香,等. 苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆[J]. 园艺学报,2014,41(2):215. |
APA | 张晓辉.,魏小春.,李锡香.,孙玉燕.,王冠.,...&韩月澎.(2014).苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆.园艺学报,41(2),215. |
MLA | 张晓辉,et al."苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆".园艺学报 41.2(2014):215. |
入库方式: OAI收割
来源:武汉植物园
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