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南方红豆杉紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列的克隆和进化分析。

文献类型:期刊论文

作者燕丽娜3; 苏应娟2; 王艇3
刊名中山大学学报:自然科学版
出版日期2009
卷号000期号:005页码:120
关键词南方红豆杉 紫杉烷7β-羟基化酶基因 正选择 负选择
ISSN号0529-6579
英文摘要从南方红豆杉Taxuswallichianavar.mairei的新鲜嫩叶中提取基因组DNA作为模板,利用三组特异引物进行PCR扩增,然后克隆测序得到紫杉烷7β-羟基化酶的基因全长。该基因编码区起始密码子为ATG,终止密码子为TGA,全长1692bp;碱基组成为490A(29.0%),351C(20.7%),362G(21.4%)和489T(28.9%)。将紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列与细胞色素P450基因家族的其它三个成员进行比对,发现它与紫杉烷2α-羟基化酶基因、紫杉烷10β-羟基化酶基因及紫杉烷13α-羟基化酶基因的一致性分别为74%、68%及76%。它们的外显子和内含子的连接区均具保守的GT—AG结构,内含子区的变异性明显高于外显子区。进一步以红豆杉属的13个紫杉烷羟基化酶基因家族成员为对象,利用位点间可变ω(非同义替换率dN和同义替换率dS的比值)模型对该基因家族的适应性进化进行分析。分支模型、位点模型以及分支一位点模型的分析表明:紫杉烷羟基化酶基因家族的少数分支处于正选择压力下(ω〉1),但未检测到正选择位点;而绝大部分位点受强烈的负选择作用(ω〈1)。
语种英语
源URL[http://202.127.146.157/handle/2RYDP1HH/16636]  
专题中国科学院武汉植物园
作者单位1.中国科学院武汉植物园
2.中山大学生命科学学院
3.中国科学院武汉植物园
推荐引用方式
GB/T 7714
燕丽娜,苏应娟,王艇. 南方红豆杉紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列的克隆和进化分析。[J]. 中山大学学报:自然科学版,2009,000(005):120.
APA 燕丽娜,苏应娟,&王艇.(2009).南方红豆杉紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列的克隆和进化分析。.中山大学学报:自然科学版,000(005),120.
MLA 燕丽娜,et al."南方红豆杉紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列的克隆和进化分析。".中山大学学报:自然科学版 000.005(2009):120.

入库方式: OAI收割

来源:武汉植物园

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