本发明涉及一种防火门胶接智能生产系统及其运行方法，属于工业生产自动化及智能制造技术领域。该生产系统包括物料准备单元、芯板喷胶单元、面板喷胶单元、翻面单元、输送单元、中央处理及云服务器单元。物料准备单元将防火门芯板和防火门面板按照指定要求堆垛到固定区域；芯板喷胶单元实现防火门芯板喷胶过程及胶接处理；面板喷胶单元实现防火门面板的喷胶处理；翻面单元实现防火门胶接后的翻面处理；输送单元实现防火门芯板和防火门面板的抓取、移动及产品的输出。本发明的生产系统结构紧凑，使用性和稳定性高，实现生产过程智能化和无人化，降低企业人工成本，提高生产效率和产品质量，可满足多种规格型号防火门的生产需求。