本实用新型公开了一种燃料电池装置，包括三室微生物燃料电池系统和外电路，三室微生物燃料电池系统包括厌氧氨氧化单元、铁氧化还原单元和光生物反应单元。在废水厌氧氨氧化过程中，厌氧氨氧化单元中的氨氮主要氧化为氮气。在铁氧化还原单元中，三价铁接收电子还原为二价铁。在铁再生过程中，铁氧化还原单元中的二价铁厌氧氧化为三价铁。光生物反应单元中的光合细菌利用电极上的电子合成单细胞蛋白。本实用新型不需要曝气和外加碳源，氨氮去除效率高，处理成本低，处理后出水中不含有铁元素，且阴极的铁元素不会流失，与添加氧化剂氧化的方式相比，节省了三价铁再生的成本。