本发明公开了一种高密度超细孔结构石墨制备方法。首先将粒径为5～50μm的中间相碳微球、粒径为5～50μm的石墨粉、粒径小于等于2μm的中间相碳微球和/或中间相碳微球微粉混合均匀为成型粉料，成型粉料中粒径为5～50μm的石墨粉的含量为1wt%～5wt%，粒径小于等于2μm的中间相碳微球和/或中间相碳微球微粉的含量为3wt%～35wt%，余量为粒径为5～50μm的中间相碳微球；然后对所述成型粉料进行成型，得到生坯；最后对所述生坯进行烧结，得到高密度超细孔结构石墨。本发明可有效解决产品开裂所导致的成品率低的问题，具有环境友好、工艺流程简单、成品性能好等优点，可实现高密度超细孔结构石墨的工业化规模生产。