工程化学数据库中分子结构信息的处理
文献类型：学位论文
| 作者 | 宋婷婷 |
| 学位类别 | 硕士 |
| 答辩日期 | 2008-05-26 |
| 授予单位 | 中国科学院过程工程研究所 |
| 授予地点 | 过程工程研究所 |
| 导师 | 温浩 |
| 关键词 | 分子结构数据库 子结构检索 VF2算法 |
| 其他题名 | The Processing of Chemical Structure Information in ECDB |
| 学位专业 | 计算机化学★ |
| 中文摘要 | 分子二维结构信息的处理是化学信息学领域研究的重要问题。本论文以工程化学数据库（ECDB）为依托，对分子二维结构信息的存储、检索和图形的绘制功能进行了研究，并开发了分子结构信息查询系统。 本论文在数据库管理系统SQL Sever 2000的环境下，利用MOL文件存储格式，构建了一个分子二维结构信息数据库；该数据库能够将MOL文件信息存储效率提高80％以上，针对分子结构匹配的VF2算法设计了特殊的存储结构，一定程度上提高了分子结构的检索效率。 分子二维结构的绘制是在GDI＋平台下开发的。本论文利用图论、几何、计算机等学科知识，同时吸取一些现有软件的绘图方法和规则，编程实现了一个能生成美观的分子结构的程序，使绘制的分子结构的环能容易被识别，分子内的键长一致，原子等符号显示无重叠、不拥挤。 针对分子二维子结构检索，本文使用了一子图匹配算法－VF2。经过测试发现，VF2算法的准确性完全能够满足要求，但匹配效率需要提高。为了确定VF2算法效率影响因素，针对提问分子的原子总数、原子出度数、高出度的个数、原子类型、匹配顺序进行了一系列测试，测试结果表明：原子个数越多，匹配时间越长；出度数越高，匹配时间越短；高出度的个数越多，匹配时间越短；杂原子个数及类型越丰富，匹配时间越短；先匹配复杂原子，可以减少匹配时间。 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2013-09-13 |
| 页码 | 77 |
| 源URL | [http://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/1234]  |
| 专题 | 过程工程研究所_研究所（批量导入） |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 宋婷婷. 工程化学数据库中分子结构信息的处理[D]. 过程工程研究所. 中国科学院过程工程研究所. 2008. |
入库方式： OAI收割
来源：过程工程研究所
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