海洋天然产物信息系统
文献类型：学位论文
| 作者 | 雷静 |
| 学位类别 | 博士 |
| 答辩日期 | 2002 |
| 授予单位 | 中国科学院过程工程研究所 |
| 授予地点 | 中国科学院过程工程研究所 |
| 导师 | 周家驹 |
| 关键词 | 海洋 天然产物 数据库 W亡b检索 数据迁移 三维结构 |
| 学位专业 | 计算机化学 |
| 中文摘要 | 海洋是一个巨大的药源宝库。本世纪60年代以来，从海洋动物、植物及微生物中已分离获得新型化合物0000多种，其中绝大部分化合物具有抗肿瘤、抗菌、抗病毒、抗凝血等药理活性；这些新型化合物为药物设计提供了可贵的分子模型，为海洋药物的开发提供了重要的先导化合物库。天然产物化学、海洋科学以及信息科学的交叉结合将对海洋天然产物科学的发展产生重要的影响。透过互联网的信息获取与处理技术、基于互联网的数据库技术、虚拟现实技术等应用于海洋天然产物领域，将有力地改变和促进海洋天然产物的开发和研究。本论文在收集了大量海洋天然产物数据的基础上，针对其数据信息特点，主要进行了以下几个方面研究：1．以数据的原始性和公开性作为数据收集的基本原则，对海洋天然产物数据进行了系统性的收集。针对海洋天然产物信息的特点，设计了海洋天然产物数据库的结构模式，定义了海洋天然产物数据域和有关信息的编码。2，通过对现有数据库管理系统的分析，结合本工作特点，选用MS SQL Server 2000关系数据库管理系统建立和管理海洋天然产物数据库。建立了包含海洋天然产物基本信息，海洋生物来源，生物活性及相关参考文献信息的英文版海洋天然产物数据库。数据库中目前约包括11，000条海洋天然产物信息。利用Visual Basic开发了数据库前端应用程序。应用Web信息服务技术，开发了海洋天然产物数据库的W亡b服务。3．举例说明了海洋天然产物信息系统的应用。对海洋天然产物信息可以进行多种方式的认厄b检索，可以获得符合检索条件的化合物的英文名称、分子式、分子量、生物活性等信息。采用ChernAxon公司提供的Java类Jchem实现了二维子结构查询。4．为了实现ISIS Base化学数据库与关系数据库的通讯，对ISIS Base数据库的SDF文件特点进行了分析，开发了ISIS Base数据库向关系数据库迁移的程序。5．分子的三维结构是进行3D一QSAR等研究的基础，目前有许多商用软件可以实现从二维信息到三维结构的转化，但造价昂贵。针对目前分子结构数据库中的分子结构大多为二维结构这一特点，结合距离几何方法，开发了分子三维结构自动构建程序，并对所产生的三维结构进行了分子力学优化。 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2013-09-16 |
| 页码 | 148 |
| 源URL | [http://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/1397]  |
| 专题 | 过程工程研究所_研究所（批量导入） |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 雷静. 海洋天然产物信息系统[D]. 中国科学院过程工程研究所. 中国科学院过程工程研究所. 2002. |
入库方式： OAI收割
来源：过程工程研究所
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