用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究
文献类型：期刊论文
| 作者 | 侯莉娟; 齐晓; 齐冬梅; 陈双燕; 刘公社
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| 刊名 | 草业学报
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| 出版日期 | 2016 |
| 卷号 | 25期号:02页码:105-113 |
| 关键词 | 羊草 转录组 SNP标记 HRM基因分型 指纹图谱 |
| ISSN号 | 1004-5759 |
| 英文摘要 | 以我国广泛分布的多年生优势禾本科牧草羊草为研究材料,针对羊草目前尚无SNP标记技术的报道,基于实验室已有的转录组数据,挖掘其中的SNP分子标记,建立一种利用高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)进行羊草SNP基因分型的方法。结果表明,从羊草转录组数据中获得41843个SNPs,转换的数量是颠换数量的2倍;建立了基于SNP的HRM基因分型方法,设计了112对SNP引物,其中有98对(87.5%)能扩增出明亮单一条带,扩增条带大小符合预期的有72对(64.29%),适宜进行HRM基因分型的引物有46对,占41.07%;用其中的7对引物可将羊草48份种质区分开,并绘制出指纹图谱。通过对部分HRM基因分型结果进行测序验证,表明测序分析的基因型结果与HRM基因分型结果一致,证明HRM基因分型结果是可靠的。本研究首次建立的基于SNP的HRM基因分型方法,可用于羊草种质资源的指纹图谱绘制、育种亲本的选配、基因关联分析、分子标记辅助育种、功能分子标记开发、新品种的保护等育种工作。 |
| 语种 | 中文 |
| 资助机构 | 国家草品种区域试验项目-羊草新品种“三性”测试(农财发[2015]36号) ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2014CB138704)资助 |
| 源URL | [http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/24894]  |
| 专题 | 中科院北方资源植物重点实验室 |
| 作者单位 | 1.中国科学院植物研究所北方资源植物重点实验室 2.中国农业科学院草原研究所 3.全国畜牧总站 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 侯莉娟,齐晓,齐冬梅,等. 用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究[J]. 草业学报,2016,25(02):105-113. |
| APA | 侯莉娟,齐晓,齐冬梅,陈双燕,&刘公社.(2016).用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究.草业学报,25(02),105-113. |
| MLA | 侯莉娟,et al."用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究".草业学报 25.02(2016):105-113. |
入库方式： OAI收割
来源：植物研究所
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