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长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布

文献类型:期刊论文

作者张琳琳 ; 李莉 ; 张国范
刊名海洋科学
出版日期2011
期号4页码:41531
关键词长牡蛎(Crassostrea gigas) EST 串联重复序列 SSR 选择压力
中文摘要长牡蛎(Crassostrea gigas)串联重复序列分析研究较少,为了研究其在基因组转录本的基本结构特征并为长牡蛎中遗传多样性研究中提供有益的信息,利用NCBI公共数据库中的57 139条长牡蛎ESTs序列对串联重复序列结构类型、分布、丰度等进行系统比较分析。分析结果表明:1)长牡蛎EST中共有小卫星串联重复序列8 392个,在大于100 bp重复类型中,162~167bp含量最高;2)长牡蛎EST SSR含量丰富,1 954个位点是EST-SSR标记开发的候选资源;3)EST-SSR重复数目和重复类型在5′UTR,CDS和3′UTR具有显著差异,CDS区承受更大的选择压力。
语种中文
公开日期2013-09-27
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/13049]  
专题海洋研究所_海洋生物技术研发中心
推荐引用方式
GB/T 7714
张琳琳,李莉,张国范. 长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布[J]. 海洋科学,2011(4):41531.
APA 张琳琳,李莉,&张国范.(2011).长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布.海洋科学(4),41531.
MLA 张琳琳,et al."长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布".海洋科学 .4(2011):41531.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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