长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘晨临 ; 黄晓航 ; 刘建国 |
| 刊名 | 海洋与湖沼
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| 出版日期 | 2011 |
| 期号 | 6页码:804-810 |
| 关键词 | 长心卡帕藻 表达序列标记分析 抗逆基因 密码子使用频率 |
| 中文摘要 | 分别采用BlastX和Blast2go软件对453条非冗余的长心卡帕藻EST序列进行匹配分析和GO注释。结果表明,有281条序列与蛋白数据库中序列匹配,有132条序列被归属为3个子本体:分子功能、生物学过程和细胞组成。同时筛选到24个与逆境适应相关的基因,包括应对胁迫反应和抗氧化反应的基因。采用GCUA软件,进行长心卡帕藻基因密码子偏倚性的研究。结果表明其密码子偏倚性与其它红藻差别较大,平均G+C含量和密码子的第三位的G+C含量均较其它藻类偏低。上述工作为进一步研究长心卡帕藻基因及其功能奠定了基础。 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2013-09-27 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/13074]  |
| 专题 | 海洋研究所_海洋生物技术研发中心 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘晨临,黄晓航,刘建国. 长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析[J]. 海洋与湖沼,2011(6):804-810. |
| APA | 刘晨临,黄晓航,&刘建国.(2011).长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析.海洋与湖沼(6),804-810. |
| MLA | 刘晨临,et al."长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析".海洋与湖沼 .6(2011):804-810. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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