运用地理信息系统对于野生大麦的基因多样性进行分析
文献类型：学位论文
| 作者 | 赵莉娜 |
| 答辩日期 | 2016-03 |
| 文献子类 | 博士后出站报告 |
| 授予单位 | 中国科学院地理科学与资源研究所 |
| 授予地点 | 中国科学院地理科学与资源研究所 |
| 导师 | 周成虎 |
| 关键词 | 野生大麦 遗传多样性 分化系数 环境胁迫 地理信息系统 |
| 学位名称 | 博士后 |
| 英文摘要 | 植物因其自身固着生长的特殊性，其生长发育和新陈代谢也必然会受到如干旱、盐碱、虫害等各种逆境的胁迫以及外界环境因素，如气候、生态系统、周围群体和其他种族的影响。众所周知，非生物胁迫是目前导致全球范围内农作物平均产量减少50%的主要原因，其中，干旱是影响最为广泛、并会对植物伤害较大的灾害。 野生大麦是一种年生，二倍体禾本科植物，并且具有很高的自交性。选用野生大麦作为研究样本可以从较大程度上避免人类因素以及杂交的影响。利用“野生大麦”和“遗传多样性”可以从Web of Knowledge上搜寻到422篇文章，经过进一步筛选，并且结合NCBI的Genbank，我们最终从中得到17个基因，共495条序列进行进一步分析。 文章及Genbak所给出的序列由分布于中东地区的44个大麦种群而来，我们利用MEGA进行对比，利用Bioedit以及matlab编写的程序运算获得分化系数。与此同时，通过GENESYS网站获得44个大麦种群所处的经度纬度，从而从World Climate网站上得到这些位点50年来的降水以及积温，利用GIS构建出空间分布状况。 通过对比选定基因及同源基因之间的分化系数，和对19个生物气候因子进行主成分分析，将影响因素进一步缩小。以ArcGIS作为工具，对分化系数和主成分因素以最小二乘法进行分析，从而获得和干旱及降水直接相关的基因。同已有研究进行比对，进一步验证了通过这一方法预测可能同干旱相关基因的可能性。不过由于原始资料过少，有2很多分析不能够完善，还需要在将来进一步进行补充。 |
| 语种 | 中文 |
| 页码 | 50 |
| 源URL | [http://ir.igsnrr.ac.cn/handle/311030/193627]  |
| 专题 | 地理科学与资源研究所_研究生部 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 赵莉娜. 运用地理信息系统对于野生大麦的基因多样性进行分析[D]. 中国科学院地理科学与资源研究所. 中国科学院地理科学与资源研究所. 2016. |
入库方式： OAI收割
来源：地理科学与资源研究所
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