青海湖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因筛选与验证
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘思嘉; 祁得林; 祁洪芳; 韩步鹰; 牛依萌; 赵凯 ; 田菲
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| 刊名 | 水产科学
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| 出版日期 | 2023 |
| 卷号 | 42期号:03页码:413-423 |
| 关键词 | 青海湖裸鲤 低温适应 实时荧光定量PCR 内参基因 |
| 英文摘要 | 为探明青海湖裸鲤候选内参基因在低温环境下的表达稳定性，根据RNA-seq定量结果筛选表达稳定的候选内参基因，利用实时荧光定量PCR检测候选基因在0℃和17℃下，脑、肝胰脏、肌肉组织中的表达量，并通过GeNorm、Norm Finder和Best Keeper 3种分析程序分析其表达稳定性，筛选出理想的内参基因。结果显示：根据RNA-seq定量结果，共筛选获得脱水酶(Abhd18)基因、微球蛋白(B2m)基因、延伸蛋白A(Eloa)基因、DAZ相关蛋白2(Dazap2)基因、肌动蛋白(Actb)基因、磷酸甘油醛脱氢酶(Gapdh)基因、BCL细胞死亡激动因子(Bad)基因和脂肪酸结合蛋白3(Fabp3)基因等8个候选基因；对上述基因的表达稳定性进行分析，发现表达最稳定的是B2m和Eloa基因，表达最不稳定的是Fabp3基因；利用B2m和Eloa基因作为双内参基因对4个脂肪酸代谢相关基因在0℃和17℃脑、肝胰脏、肌肉组织中的表达量进行校正，其相对表达比值与RNA-seq结果高度正相关。研究结果可为高原鱼类极端环境适应的研究提供候选内参基因。 |
| 源URL | [http://210.75.249.4/handle/363003/61776]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘思嘉,祁得林,祁洪芳,等. 青海湖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因筛选与验证[J]. 水产科学,2023,42(03):413-423. |
| APA | 刘思嘉.,祁得林.,祁洪芳.,韩步鹰.,牛依萌.,...&田菲.(2023).青海湖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因筛选与验证.水产科学,42(03),413-423. |
| MLA | 刘思嘉,et al."青海湖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因筛选与验证".水产科学 42.03(2023):413-423. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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