一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现
文献类型:期刊论文
作者 | 张佩珩; 刘新春; 江先阳 |
刊名 | 计算机研究与发展
![]() |
出版日期 | 2005 |
卷号 | 42.0期号:006页码:930 |
关键词 | 全局Smith-Waterman算法 可重构 硬件加速卡 FPGA |
ISSN号 | 1000-1239 |
英文摘要 | 人类基因组测序工作完成后,对基因数据的处理和分析能力提出了更高的要求.生物信息学的基本研究方法之一就是计算,其算法的特点是数据量较大、算法比较简单、运算类型单一、重复性较强、潜在的并行度较高.用现有的大规模并行机或超级服务器等通用系统解决这些问题,既浪费系统的资源,使用维护也比较复杂,有些问题甚至无法在限定的时间内完成.提出了一种。比较通用的算法可重构硬件加速卡的体系结构,以全局Smith-Waterman算法为例,阐述了从算法到硬件实现的映射过程,并指出了将其他类型算法映射到该加速卡上的可行性. |
语种 | 英语 |
源URL | [http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/29776] ![]() |
专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文 |
作者单位 | 中国科学院计算技术研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 张佩珩,刘新春,江先阳. 一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现[J]. 计算机研究与发展,2005,42.0(006):930. |
APA | 张佩珩,刘新春,&江先阳.(2005).一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现.计算机研究与发展,42.0(006),930. |
MLA | 张佩珩,et al."一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现".计算机研究与发展 42.0.006(2005):930. |
入库方式: OAI收割
来源:计算技术研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明,本系统中所有内容都受版权保护,并保留所有权利。