扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测
文献类型：期刊论文
| 作者 | 李泽2; 王松建3; 杨涛1; 李旭4; 郭衍志2; 但芸婕2; 徐宝艳2; 邓国宏2 |
| 刊名 | 第三军医大学学报
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| 出版日期 | 2016 |
| 卷号 | 38期号:13页码:1471 |
| 关键词 | 扎伊尔型 埃博拉病毒 荧光定量PCR 标签序列 鉴定 |
| ISSN号 | 1000-5404 |
| 英文摘要 | 目的建立一种快速准确检测扎伊尔型埃博拉病毒(Zaire ebola virus,ZEBOV)的方法。方法以2014年西非新分离的3株ZEBOV全基因组参考序列及1976年从Mayinga分离的ZEBOV株(NC_002549)为目标,基于Insignia系统算法与GenBank中Nt库比对,求出ZEBOV特异性核酸标签序列。设计引物、Taq Man探针和优化反应条件,以10倍系列稀释的阳性质粒做标准曲线,做准确性、重复性实验。并以其余4个亚型的埃博拉病毒、马尔堡病毒、西尼罗河热病毒、东方马脑炎病毒、西方马脑炎病毒等8种病毒对照及临床48例患者复杂样本为对照做特异性检测。结果选择比对得到的特异性标签序列(KJ660348,11331-11514)设计探针引物,标准曲线相关系数>0.99,灵敏度可达5×10~1拷贝。准确性重复性实验结果批内变异系数(CV)为0.88%~2.50%、批间CV为1.75%~3.31%。8种病毒及临床48例患者复杂样本对照均为阴性。结论ZEBOV核酸标签(KJ660348,11331-11514)在非编码区,在此基础上建立的荧光定量PCR方法可特异性检测ZEBOV,且灵敏、重复性好。 |
| 语种 | 英语 |
| 源URL | [http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/34683]  |
| 专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文 |
| 作者单位 | 1.解放军77128部队 2.第三军医大学西南医院全军感染病研究所 3.重庆大学计算机学院 4.中国科学院计算技术研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李泽,王松建,杨涛,等. 扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测[J]. 第三军医大学学报,2016,38(13):1471. |
| APA | 李泽.,王松建.,杨涛.,李旭.,郭衍志.,...&邓国宏.(2016).扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测.第三军医大学学报,38(13),1471. |
| MLA | 李泽,et al."扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测".第三军医大学学报 38.13(2016):1471. |
入库方式： OAI收割
来源：计算技术研究所
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