基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究
文献类型:期刊论文
作者 | 任菲1; 张法2; 张阳德1 |
刊名 | 中国现代医学杂志
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出版日期 | 2012 |
页码 | 15 |
关键词 | 结构域 同源直系 聚类 真核生物 |
ISSN号 | 1005-8982 |
英文摘要 | 目的探讨直系同源蛋白质聚类分析的方法,为高效、快速的直系同源蛋白质聚类分析研究提供有效帮助。方法基于蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,提出一种直系同源蛋白质聚类方法,实现了直系同源蛋白质的快速、精确聚类。结果对人类、酵母、蠕虫、果蝇、拟南芥和斑马鱼等六种真核生物序列直系同源蛋白质的聚类分析,结果明显优于NCBI和TIGR的聚类结果。结论利用蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,可以有效筛选出假的同源关系,进而显著提高直系同源蛋白聚类的精确性和紧密性。 |
语种 | 英语 |
源URL | [http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/36453] ![]() |
专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文 |
作者单位 | 1.中南大学 2.中国科学院计算技术研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 任菲,张法,张阳德. 基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究[J]. 中国现代医学杂志,2012:15. |
APA | 任菲,张法,&张阳德.(2012).基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究.中国现代医学杂志,15. |
MLA | 任菲,et al."基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究".中国现代医学杂志 (2012):15. |
入库方式: OAI收割
来源:计算技术研究所
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