Smith-Waterman算法在脉动阵列上的实现及分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 汪冬; 唐志敏 |
| 刊名 | 计算机学报
 |
| 出版日期 | 2004 |
| 卷号 | 27.0期号:1.0页码:12 |
| 关键词 | Smith-Waterman算法 脉动阵列 序列比对算法 计算机 生物信息学 |
| ISSN号 | 0254-4164 |
| 英文摘要 | Smith-Waterman算法是一种经典的序列比对算法，在双序列比对的情况下具有比较好的性能，但是在大规模的序列比对时，其性能并不能令人满意。脉动式阵列和Smith-Waterman算法有比较好的吻合性。该文通过在龙芯1号处理器上附加一个脉动式阵列的协处理器，构建了硬件模型。通过模拟器的验证，附加了协处理器的龙芯1号的性能与没有附加协处理器时的性能之比接近于线性。该文最后根据硬件模型和模拟器的性能数据，具体分析了系统各个方面对性能提高的影响。 |
| 语种 | 英语 |
| 源URL | [http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/37061]  |
| 专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文 |
| 作者单位 | 中国科学院计算技术研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 汪冬,唐志敏. Smith-Waterman算法在脉动阵列上的实现及分析[J]. 计算机学报,2004,27.0(1.0):12. |
| APA | 汪冬,&唐志敏.(2004).Smith-Waterman算法在脉动阵列上的实现及分析.计算机学报,27.0(1.0),12. |
| MLA | 汪冬,et al."Smith-Waterman算法在脉动阵列上的实现及分析".计算机学报 27.0.1.0(2004):12. |
入库方式： OAI收割
来源：计算技术研究所
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