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仿刺参两个caspase的免疫功能研究

文献类型:学位论文

作者朱晗硕
答辩日期2024-05
文献子类硕士
授予单位中国科学院大学
授予地点中国科学院海洋研究所
导师孙黎
关键词仿刺参 caspase 细胞凋亡 抗菌效应
学位名称理学硕士学位
英文摘要

Caspasecysteinyl aspartate specific proteinase, CASP)是一类含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,介导细胞凋亡等多种形式的细胞死亡,在生物体生长、发育和免疫过程中发挥重要作用。哺乳动物中, 至少18caspase被研究和报道。仿刺参(Apostichopus japonicus)是我国重要海洋经济物种。基因组测序表明,仿刺参拥有多个caspase基因。然而,目前对仿刺参caspase的研究大多是检测其在不同条件下的转录表达变化,这些caspase的具体免疫功能和作用机制有待深入探索。

在本研究中,我们从仿刺参中鉴定出两种未见报道的caspase,分别命名为AjCASPX1AjCASPX2AjCASPX1AjCASPX2分别由426427个氨基酸组成,分子量分别为47.52 kDa49.17 kDa,理论等电点分别为6.585.91。二者均由一个NCARD结构域和一个Ccaspase 结构域(CASc)构成。系统发育分析和关键位点分析结果表明AjCASPX1AjCASPX2分别与哺乳动物CASP9CASP2家族有较近的进化关系。然而,AjCASPX1AjCASPX2具有一些独特的结构特征。不同于人Homo sapiens CASP2/9AjCASPX1AjCASPX2p20p10亚基连接区存在一个α-螺旋。细胞实验结果显示,AjCASPX1能够诱导HEK293T细胞发生凋亡,在此过程中伴随CASP3/7激活。在AjCASPX1诱发的凋亡晚期lactate dehydrogenase (LDH) 释放以及Annexin V+/PI- 细胞显著增加。不同于AjCASPX1AjCASPX2只能诱导非常微弱的细胞凋亡。AjCASPX2以及AjCASPX2CARD结构域(命名为CARDAjCASPX2)能够结合多种革兰氏阳性/阴性细菌以及细菌表面组分脂多糖(LPS)与肽聚糖(PGN)。AjCASPX2以及CARDAjCASPX2与病原菌哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)结合后能够显著抑制细菌生长。AjCASPX1在大肠杆菌中表达后能杀死宿主细菌。qRT-PCR结果表明,正常生理条件下,AjCASPX1AjCASPX2在呼吸树、肌肉、体腔细胞以及肠道中均有分布,分别在肌肉和体腔细胞中呈现最高量表达。V. harveyi感染仿刺参后,AjCASPX1AjCASPX2在各组织中的表达均出现显著上调。与此类似,V. harveyi体外感染仿刺参体腔细胞后,也能诱导AjCASPX1AjCASPX2的表达变化

上述结果表明,AjCASPX1AjCASPX2参与细胞凋亡和抗感染免疫。本研究加深了对仿刺参caspase免疫功能的理解,并为海参养殖病害防控提供了理论指导。

语种中文
目次

第1章 绪论 1

1.1 免疫系统概述 1

1.1.1 免疫的基本概念与功能 1

1.1.2 海参的免疫系统 2

1.2 Caspase概述 6

1.2.1 Caspase的结构与分类 6

1.2.2 Caspase与细胞死亡 8

1.2.3 海参caspase的研究进展 11

1.3 研究目的及意义 11

第2章 实验材料与方法 13

2.1 实验材料 13

2.1.1 实验动物 13

2.1.2 实验细胞系及菌株 13

2.1.3 实验仪器 13

2.1.4 实验试剂 15

2.1.5 常用实验溶液的配制方法 16

2.1.6 序列分析及数据处理软件 18

2.2 实验方法 19

2.2.1 基因克隆 19

2.2.2 AjCASPX1和AjCASPX2的生物信息学分析 22

2.2.3 构建AjCASPX1/X2的真核与原核表达载体 23

2.2.4 HEK293T细胞转染与显微镜观察 27

2.2.5 LDH释放检测 29

2.2.6 流式细胞术检测细胞凋亡 30

2.2.7 转染细胞酶活检测 30

2.2.8 Western Blot检测转染细胞AjCASPX1/X2的表达和激活 31

2.2.9 重组蛋白原核表达纯化 32

2.2.10 AjCASPX2/CARDAjCASPX2 与细菌体外结合能力检测 34

2.2.11 AjCASPX2/CARDAjCASPX2 与病原相关分子模式体外结合能力检测 35

2.2.12 AjCASPX2/CARDAjCASPX2对细菌生长的影响 35

2.2.13 AjCASPX1对细菌存活的影响 36

2.2.14 正常生理条件下AjCASPX1/X2的组织分布情况 36

2.2.15 细菌感染后AjCASPX1/X2的表达情况变化 38

第3章 实验结果 40

3.1 AjCASPX1和AjCASPX2的生物信息学分析 40

3.2 AjCASPX1/X2能够引起HEK293T细胞发生凋亡 44

3.3 AjCASPX2/CARDAjCASPX2与细菌的结合特征 47

3.4 AjCASPX2/CARDAjCASPX2与病原相关分子模式的结合特征 48

3.5 AjCASPX2/CARDAjCASPX2能够抑制细菌生长 49

3.6 AjCASPX1具有杀菌效应 50

3.7 正常生理状态下AjCASPX1/X2的组织分布 50

3.8 感染状态下AjCASPX1/X2的表达变化 51

第4章 讨论 54

第5章 结论与展望 57

参考文献 58

致  谢 64

作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与其他相关学术成果 66

源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/185294]  
专题海洋研究所_实验海洋生物学重点实验室
推荐引用方式
GB/T 7714
朱晗硕. 仿刺参两个caspase的免疫功能研究[D]. 中国科学院海洋研究所. 中国科学院大学. 2024.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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