力致粘着斑激酶FAT结构域去折叠的分子模拟
文献类型：期刊论文
| 作者 | 杨晴; 龚明亮; 吕守芹 ; 龙勉
|
| 刊名 | 医用生物力学
 |
| 出版日期 | 2024-08-15 |
| 卷号 | 39期号:S1页码:679 |
| 关键词 | 去折叠 Paxillin FAK 结构域 FAT 粘着斑激酶 分子模拟 |
| ISSN号 | 1004-7220 |
| 英文摘要 | 目的 黏着斑激酶(focal adhesion kinase,FAK)依赖其激酶和支架功能的协同作用介导细胞迁移、分化等生物学过程,而其C端的FAT(Focal Adhesion Targeting Domain)结构域是FAK支架功能的载体,直接参与和Src、Paxillin、Talin等蛋白的结合。作为调控细胞感知外界力学微环境的重要分子体系,力学因素如何调控FAK自身结构,尤其是FAT结构域,进而调控其功能尚不清楚。方法 首先利用平衡分子动力学进行FAT平衡模拟,评估其结构稳定性;接着采用力致分子动力学进行FAT去折叠模拟,考察其力致去折叠过程;最后采用分子对接方法,考察不同去折叠构象态与配体Paxillin的结合能力,分析外力对FAT-Paxillin相互作用的调控。结果FAT结构域在受力去折叠过程中出现3个典型结构,伸长量分别在5、13、23 nm左右,并且发现其N端和H4螺旋之间两对盐桥(D922-R1042和D1039-R919)的破坏是FAT开始发生去折叠的关键。进一步通过比较未发生去折叠以及三个典型去折叠中间态分别与Paxillin的LD2和LD4结构域对接的结合自由能,发现第一态具有最强的结合能力,提示力对FAT-Paxillin相互作用的调控作用。结论 本工作从微观结构动力学角度考察了FAT结构域的结构-功能关系,为深入阐释FAK的生物学功能提供基础。 |
| 语种 | 中文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金项目,T2394512,32130061,12172366 |
| 其他责任者 | 吕守芹 |
| 源URL | [http://dspace.imech.ac.cn/handle/311007/96652]  |
| 专题 | 力学研究所_国家微重力实验室 |
| 作者单位 | 1.重庆大学生物工程学院 2.中国科学院大学工程科学学院 3.中国科学院力学研究所,微重力重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 杨晴,龚明亮,吕守芹,等. 力致粘着斑激酶FAT结构域去折叠的分子模拟[J]. 医用生物力学,2024,39(S1):679. |
| APA | 杨晴,龚明亮,吕守芹,&龙勉.(2024).力致粘着斑激酶FAT结构域去折叠的分子模拟.医用生物力学,39(S1),679. |
| MLA | 杨晴,et al."力致粘着斑激酶FAT结构域去折叠的分子模拟".医用生物力学 39.S1(2024):679. |
入库方式： OAI收割
来源：力学研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。