普氏野马分布区域亚洲璃眼蜱的宏基因组分析与病原体评估
文献类型：期刊论文
| 作者 | 张钰; 张科; 刘佳伟; 王安琪; 团勇; 张东; 闫利平; 李凯 |
| 刊名 | 中国寄生虫学与寄生虫病杂志
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| 出版日期 | 2024 |
| 卷号 | 42期号:04页码:439-446+453 |
| 关键词 | 亚洲璃眼蜱 蜱传疾病 宏基因组学 性别差异 普氏野马 |
| 英文摘要 | 目的 评估亚洲璃眼蜱在普氏野马分布区域传播疾病的潜在风险，研究雌、雄蜱在宏基因组水平的特征并进行病原体分析。方法 2022年4月，在新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区使用“守株待蜱”法采集硬蜱，利用体视镜进行形态学鉴定，提取48只蜱（雌、雄各24只） DNA,PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶第1亚基（COⅠ）序列进行分子生物学鉴定。将雌、雄亚洲璃眼蜱分组进行宏基因组测序，非冗余基因集与非冗余蛋白（NR）数据库进行比对，分析蜱携带的微生物群落组成；与京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库和抗生素抗性基因数据库（ARDB）进行比对，获取蜱及蜱传病原体的基因功能注释结果以及抗生素抗性功能注释结果。数据的比较采用t检验分析。结果 共采集硬蜱124只，经形态学鉴定亚洲璃眼蜱成虫119只。硬蜱DNA扩增出约700 bp的阳性条带，经测序与亚洲璃眼蜱（GenBank:MH459386.1）的序列一致性为99%～100%。宏基因组测序经质控过滤共获得469 327 812条序列读长，开放阅读框预测得到836 843～1 094 994条序列。NR数据库比对结果显示，亚洲璃眼蜱携带的细菌菌落丰度占注释到的总群落丰度的99.13%，共注释到细菌32门2 040种，变形菌门和放线菌门为优势菌门，分别占细菌群落丰度的51.52%和44.35%；嗜吞噬细胞无形体为优势菌种，占细菌群落丰度的16.35%。病毒菌落丰度占注释到的总群落丰度的0.004%，共注释到病毒5门21种。雌蜱和雄蜱携带的细菌群落和病毒群落的丰富度及多样性差异均无统计学意义（t=-1.180、-1.729，均P> 0.05）。KEGG基因功能注释到亚洲璃眼蜱新陈代谢基因占比最高（54.38%），主要的功能条目为氨基酸代谢、碳水化合物代谢、膜转运等；共识别出11 352种蛋白通路，其中154种蛋白通路在雌蜱和雄蜱间的差异有统计学意义（t=-2.348,P <0.05）。ARDB注释到亚洲璃眼蜱携带154种抗生素抗性基因，包括49种抗性基因类型，主要抗性基因类型为Baca （占62.53%），抗生素类型为肝菌肽。大部分注释到的抗性基因与多重耐药相关，如Mexf、Mexb、Emrd、Mexw等。雌蜱和雄蜱在抗生素抗性基因类型的差异性对比结果显示，仅雌蜱的Emrd基因抗性高于雄蜱（t=-7.558,P <0.05）。结论 本研究在宏基因组水平上揭示了亚洲璃眼蜱携带的主要细菌、病毒群落及多重耐药相关的抗生素抗性基因，雌蜱及其携带的病原体具有较高的物种丰度和基因丰度。 |
| 源URL | [http://210.75.249.4/handle/363003/62213]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张钰,张科,刘佳伟,等. 普氏野马分布区域亚洲璃眼蜱的宏基因组分析与病原体评估[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2024,42(04):439-446+453. |
| APA | 张钰.,张科.,刘佳伟.,王安琪.,团勇.,...&李凯.(2024).普氏野马分布区域亚洲璃眼蜱的宏基因组分析与病原体评估.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,42(04),439-446+453. |
| MLA | 张钰,et al."普氏野马分布区域亚洲璃眼蜱的宏基因组分析与病原体评估".中国寄生虫学与寄生虫病杂志 42.04(2024):439-446+453. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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