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不同生长年限唐古特大黄根转录组学分析及蒽醌类生物合成基因挖掘

文献类型:期刊论文

作者赵硕; 王玲玲; 李嘉楠; 陈晨; 周国英
刊名中药材
出版日期2024
期号04页码:851-856
关键词唐古特大黄 转录组 不同生长年限 蒽醌生物合成 差异表达基因
英文摘要目的:分析不同生长年限唐古特大黄根转录组变化情况,确定参与蒽醌生物合成的关键基因,以便解析蒽醌类化合物生物合成的分子调控机制。方法:使用高通量测序技术、基因功能注释、同源性搜索和q RT-PCR验证,鉴定参与唐古特大黄蒽醌类化合物生物合成的相关基因。结果:原始数据经组装得到97 499个unigenes,N50为2 371 bp,其中69.42%的基因被注释。不同年限样品中共鉴定出7 349个差异表达基因,5年生与8年生之间的差异基因数量更少。鉴定出251个unigenes参与蒽醌生物合成途径,其中25个至少在一个对照组间呈现差异表达。利用q RT-PCR验证部分基因表达变化情况同转录组分析结果一致。进一步筛选出8个PKSⅢ基因,其中4个为CHS-like基因,PKS6和PKS7在蒽醌积累高峰期显示高表达。结论:初步推测,基因PKS6和PKS7可能调控蒽醌在根中的年际积累,该结果将有助于后续唐古特大黄中蒽醌类成分合成机制的研究。
源URL[http://210.75.249.4/handle/363003/62246]  
专题西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
赵硕,王玲玲,李嘉楠,等. 不同生长年限唐古特大黄根转录组学分析及蒽醌类生物合成基因挖掘[J]. 中药材,2024(04):851-856.
APA 赵硕,王玲玲,李嘉楠,陈晨,&周国英.(2024).不同生长年限唐古特大黄根转录组学分析及蒽醌类生物合成基因挖掘.中药材(04),851-856.
MLA 赵硕,et al."不同生长年限唐古特大黄根转录组学分析及蒽醌类生物合成基因挖掘".中药材 .04(2024):851-856.

入库方式: OAI收割

来源:西北高原生物研究所

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