基于基因组重测序的藏羚Y染色体多态性遗传位点筛选
文献类型：期刊论文
| 作者 | 王舒闻; 王东; 成若通; 陈玉莹; 李佳宾; 陈一博; 陈家瑞 ; 魏青
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| 刊名 | 四川动物
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| 出版日期 | 2024 |
| 卷号 | 43期号:01页码:24-33 |
| 关键词 | 藏羚 基因组重测序 Y染色体 SNP SSR |
| 英文摘要 | 藏羚Pantholops hodgsonii是藏羚属Pantholops现存的唯一物种，由于Y染色体基因较保守，基于近缘物种的Y染色体多态性遗传位点筛选受到了很大的限制。本研究对15份藏羚新鲜组织样品进行基因组重测序，生物信息分析筛选出Y染色体雄性特异区（MSY）对应的scaffolds，对部分SNP及SSR位点进行多态性验证。共比对出44个scaffolds，以其中序列最长、候选变异位点最多且最完整的KE113803.1为参考，对其中190个SNP变异位点设计引物进行验证，共获得45条MSY DNA序列，其中15对引物扩增到的11 898 bp DNA序列中检测到27个SNP位点；同时对KE113803.1中除单核苷酸重复以外的134个SSR位点设计引物并验证多态性，筛选出56个Y-SSR位点，其中5个具有多态性。本研究结果为后续分析藏羚Y染色体遗传多样性及父系遗传奠定了良好基础。 |
| 源URL | [http://210.75.249.4/handle/363003/62290]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王舒闻,王东,成若通,等. 基于基因组重测序的藏羚Y染色体多态性遗传位点筛选[J]. 四川动物,2024,43(01):24-33. |
| APA | 王舒闻.,王东.,成若通.,陈玉莹.,李佳宾.,...&魏青.(2024).基于基因组重测序的藏羚Y染色体多态性遗传位点筛选.四川动物,43(01),24-33. |
| MLA | 王舒闻,et al."基于基因组重测序的藏羚Y染色体多态性遗传位点筛选".四川动物 43.01(2024):24-33. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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