青藏高原不同海拔藏药独一味转录组分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 李孝平; 徐浩; 余静雅; 韩赟; 韩霜 ; 张发起
|
| 刊名 | 基因组学与应用生物学
 |
| 出版日期 | 2024 |
| 卷号 | 43期号:02页码:338-352 |
| 关键词 | 转录组 独一味 低温胁迫 P5βR基因亚家族 环烯醚萜合成酶 |
| 英文摘要 | 为了研究独一味(Phlomoides rotata)在不同海拔生境下基因表达差异及响应机制，本研究基于NR、 GO和KEGG等数据库进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)的注释，以及功能富集分析，获得独一味的DEGs,以及关联的代谢通路，并对注释获得的药用基因进行系统发育分析。结果显示，不同海拔独一味的DEGs,主要富集到植物激素信号转导、氨基酸的生物合成、萜类等次生代谢生物合成途径。其中，有4个基因在低温胁迫响应中起关键作用；鉴定出3个P5βR基因，其中2个基因编码环烯醚萜合成途径中的关键酶。系统发育结果显示，P5βR基因亚家族聚为两个分支(P5βR clusterⅠ和P5βR clusterⅡ)。本研究在转录组水平上发现独一味主要通过多种代谢途径，以及关键基因的调控表达来适应青藏高原高海拔生境。本研究为独一味不同海拔适应机制及独一味耐寒育种提供了数据支撑，为P5βR基因亚家族和环烯醚萜类生物合成的研究奠定基础。 |
| 源URL | [http://210.75.249.4/handle/363003/62294]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李孝平,徐浩,余静雅,等. 青藏高原不同海拔藏药独一味转录组分析[J]. 基因组学与应用生物学,2024,43(02):338-352. |
| APA | 李孝平,徐浩,余静雅,韩赟,韩霜,&张发起.(2024).青藏高原不同海拔藏药独一味转录组分析.基因组学与应用生物学,43(02),338-352. |
| MLA | 李孝平,et al."青藏高原不同海拔藏药独一味转录组分析".基因组学与应用生物学 43.02(2024):338-352. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。