利用SNP标记鉴定青稞种质资源
文献类型：期刊论文
| 作者 | 陈同睿; 王蕾; 王寒冬 ; 尤恩; 邓超; 边海燕; 沈裕虎; 徐金青
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| 刊名 | 麦类作物学报
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| 出版日期 | 2024 |
| 卷号 | 44期号:01页码:65-73 |
| 关键词 | 青稞 种质资源 核心SNP 指纹图谱 分子身份证 |
| 英文摘要 | 近年来，青稞(Hordeum vulgare var.nudum Hook. f.)育种速度逐步加快，青稞品种的类别和数量日渐增多，形成了丰富的青稞品种资源。然而，在青稞资源的大量引种和品种资源交换过程中，造成了同名异物、同物异名的现象，因而建立高效、准确的青稞品种鉴定技术体系和数据系统迫在眉睫。为基于青稞品种基本信息实现青稞品种的快速和准确鉴定，本研究利用简化基因组(GBS)测序获得的青稞基因组高通量SNP基因分型数据，对314份青稞种质资源进行群体结构分析；根据SNP注释结果，筛选获得位于外显子区的SNP并计算其杂合率和遗传多态性指数；用Genstat的去冗余(IRREDUNDANT)指令通过顺序算法(sequential algorithm)获得能够区分参试青稞种质资源的核心SNP位点组合，并构建DNA指纹图谱，结合参试材料地理来源等基本信息构建青稞品种的分子身份证。结果表明，群体遗传结构分析可将314份参试青稞材料划分为3个类群，类群划分与其材料类型密切相关。从4 954个位于外显子区域的高质量SNP位点中筛选出14个多态性高且能完全区分青稞种质资源的SNP位点，称其为核心SNP;由14个核心SNP组成青稞种质资源DNA指纹图谱，同时结合种质资源地理来源等的基本信息进行数字编码，最终构建了每份青稞品种资源由17位数字组成的具有唯一标识的分子身份证，并生成相应的条形码和二维码。本研究构建的青稞种质资源DNA指纹图谱和分子身份证，可为青稞品种真实性和纯度鉴定、种质管理及知识产权保护等提供参考。 |
| 源URL | [http://210.75.249.4/handle/363003/62295]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 陈同睿,王蕾,王寒冬,等. 利用SNP标记鉴定青稞种质资源[J]. 麦类作物学报,2024,44(01):65-73. |
| APA | 陈同睿.,王蕾.,王寒冬.,尤恩.,邓超.,...&徐金青.(2024).利用SNP标记鉴定青稞种质资源.麦类作物学报,44(01),65-73. |
| MLA | 陈同睿,et al."利用SNP标记鉴定青稞种质资源".麦类作物学报 44.01(2024):65-73. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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