RNA-Seq挖掘黄绿卷毛菇中核黄素合成途径差异表达基因
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘峰; 曹东; 宗渊; 李云; 魏乐; 刘宝龙 |
| 刊名 | 分子植物育种
 |
| 出版日期 | 2024 |
| 卷号 | 22期号:01页码:77-84 |
| 关键词 | 黄绿卷毛菇 双孢蘑菇 差异表达 核黄素 |
| 英文摘要 | 为探究黄绿卷毛菇和双孢蘑菇的基因表达差异，挖掘黄绿卷毛菇核黄素合成途径的主效基因，本研究利用RNA-Seq技术对黄绿卷毛菇和双孢蘑菇进行二代转录组测序与生物信息学分析。结果表明，黄绿卷毛菇和双孢蘑菇中共检测到26 818个基因差异表达，其中11 236个基因在黄绿卷毛菇中表达上调，15 582个基因表达下调。KEGG富集结果显示，共有19 988个差异表达基因参与植物次生代谢产物合成，其中在维生素代谢途径中有813个差异表达基因。在核黄素代谢通路中，黄绿卷毛菇和双孢蘑菇中共有5个参与核黄素合成代谢的结构基因没有产生差异表达，有6个在黄绿卷毛菇中呈现不同程度上调。核黄素转运蛋白MCH5的同源基因CL911.Contig3＿ALL（Almch5）在黄绿卷毛菇中特异表达，log2FC值高达12.98，同时Almch5与斑玉蕈（Hypsizygus marmoreus）中核黄素转运蛋白MCH5高度同源，都具有相似的7bp3.1A转运蛋白功能域，表明Almch5可能是转运黄绿卷毛菇中核黄素的主效蛋白，这为黄绿卷毛菇中核黄素合成机制研究提供了新线索。 |
| 源URL | [http://210.75.249.4/handle/363003/62305]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘峰,曹东,宗渊,等. RNA-Seq挖掘黄绿卷毛菇中核黄素合成途径差异表达基因[J]. 分子植物育种,2024,22(01):77-84. |
| APA | 刘峰,曹东,宗渊,李云,魏乐,&刘宝龙.(2024).RNA-Seq挖掘黄绿卷毛菇中核黄素合成途径差异表达基因.分子植物育种,22(01),77-84. |
| MLA | 刘峰,et al."RNA-Seq挖掘黄绿卷毛菇中核黄素合成途径差异表达基因".分子植物育种 22.01(2024):77-84. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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