凡纳滨对虾类胰岛素肽基因的结构及表达分析
文献类型:CNKI期刊论文
作者 | 苏曼文![]() ![]() |
发表日期 | 2023-03-15 |
出处 | 渔业科学进展
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关键词 | 凡纳滨对虾 类胰岛素肽 基因结构 功能预测 表达分析 |
英文摘要 | 类胰岛素肽(ILP)是胰岛素超家族的成员,具有进化保守性,是影响动物生命活动的重要因子之一。本研究克隆了凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei) ILP1 (Lv ILP1)全长基因,m RNA长度为812 bp,其中开放阅读框长543 bp,编码180个氨基酸。序列分析显示,Lv ILP1蛋白预计分子量为20.81 kDa,理论等电点为9.45,不稳定系数为96.20,具有一个信号肽,没有跨膜结构,推导其为碱性、不稳定的分泌蛋白。结构预测显示,该蛋白具有胰岛素超家族保守的Il GF结构域,由N端信号肽、B链、C肽和A链组成,同时具有6个保守的半胱氨酸位点和2个断裂位点。系统进化分析显示,Lv ILP1与斑节对虾(Penaeus monodon) ILP7亲缘关系最近,与甲壳动物ILP1聚为一支,然后分别与无脊椎动物ILP7、脊椎动物松弛素(Relaxin)、胰岛素(Insulin)、胰岛素样生长因子(IGF)聚在一起。无脊椎动物ILP7类与外群海葵(Actinia tenebrosa)ILP的进化关系最近,表明这类ILP可能与胰岛素超家族的祖先较为相似。转录因子预测显示,Lv ILP1可能的转录因子为叉头框蛋白O3(FoxO3)、糖皮质激素受体(GR)、CAAT区/增强子结合蛋白(C/EBP)、信号传导及转录激活蛋白(STAT)等;蛋白互作分析显示,Lv ILP1与细胞膜上的胰岛素受体(IR)、神经信号分子(VGLUT1、SYT 1_3)、糖蛋白激素(GPHB5)、鞣化激素(Bursicon)等相互作用;对这些转录因子和互作蛋白的生物功能进行分析,进而推测Lv ILP1可能具有调节生长发育、激素刺激反应、神经系统稳态、碳水化合物稳态、蜕皮后组织重建以及生殖发育等作用。分析发现,Lv ILP1在凡纳滨对虾早期发育阶段有较高表达,在成体各个组织中均有表达,但在眼柄中表达量最高。本研究结果为深入了解凡纳滨对虾ILP的基因结构、进化、功能及表达提供了重要信息,同时为凡纳滨对虾的分子育种和健康养殖提供线索。 |
DOI标识 | 10.19663/j.issn2095-9869.20220901003 |
文献子类 | CNKI期刊论文 |
资助机构 | 国家自然科学基金(31972782 ; 32273102) ; 国家重点研发计划(2018YFD0900103 ; 2018YFD0900404) ; 中国科学院先导专项(XDA24030105) ; 财政部和农业农村部:现代农业产业技术体系(CARS-48)共同资助 |
卷 | v.45期:01页:108-120 |
语种 | 中文; |
分类号 | S917.4 |
ISSN号 | 2095-9869 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/187163] ![]() |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所中国科学院实验海洋生物学重点实验室 2.海洋生物学与生物技术功能实验室 3.中国科学院大学 4.福州市海洋与渔业技术中心 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 苏曼文,张晓军,袁剑波,等. 凡纳滨对虾类胰岛素肽基因的结构及表达分析. 2023. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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