南极红藻Iridaea cordata和Curdiea racovitzae转录组分析及其极端光环境适应相关基因的挖掘
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 刘晨临; 王秀良; 林学政 |
| 发表日期 | 2020-10-15 |
| 出处 | 海洋学报
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| 关键词 | 南极红藻 转录组 极端光环境适应 Iridaea cordata Curdiea racovitzae |
| 英文摘要 | 南极红藻具有重要的生态学功能和开发利用价值。南极极端环境赋予了其独特的生理耐受机制,也是发现新基因和代谢途径的理想材料。我们测序分析了南极产胶红藻Iridaea cordata (Turner) Bory和Curdiea racovitzae Hariot的转录组序列,并与其常温近缘种进行了比较,同时挖掘了其与光限制和强紫外线辐射等光环境适应相关的基因。I. cordata和C. racovitzae的转录组序列分别拼接成了14 055条和12 006条非冗余基因,平均长度分别为1 473 bp和1 448 bp。在I. cordata转录组中发现多条与绿藻基因同源的捕光复合物LHC基因Lhca2、Lhca6和Lhcb,并且在两种南极红藻中都各发现了1条编码结合岩藻黄质和Chl a/c蛋白的Lhcf基因,目前尚未在其他红藻中发现这类基因。光裂解酶修复紫外线诱导DNA损伤,在I. cordata的转录组序列中发现了6-4光裂解酶,光裂解酶CPD Ⅰ和CPD Ⅱ基因,而C. racovitzae转录组序列中仅找到了光裂解酶CPD Ⅱ基因。尽管南极红藻中这些特有基因的功能有待进一步的验证,但是本文为后续研究红藻的南极极端光环境适应机制提供了方向。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金（41276203） ; 国家南极观测监测网运维与管理项目（JDKC0518013） |
| 卷 | v.42期:10页:114-124 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | Q943.2 |
| ISSN号 | 0253-4193 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/187977]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.自然资源部第一海洋研究所 2.青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术实验室 3.中国科学院海洋研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘晨临,王秀良,林学政. 南极红藻Iridaea cordata和Curdiea racovitzae转录组分析及其极端光环境适应相关基因的挖掘. 2020. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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