凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 杜江丽 ; 张晓军; 张小溪; 袁剑波; 高羿; 李富花; 相建海
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| 发表日期 | 2019-02-20 |
| 出处 | 水产学报
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| 关键词 | 凡纳滨对虾 E75基因 蜕皮 可变剪接 RNA干扰 |
| 英文摘要 | E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子。为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE75-1、LvE75-2、LvE75-3、LvE75-4、LvE75-5和LvE75-6。其中LvE75-1/2/4/5/6均包含DBD和LBD结构域,与果蝇E75A/C有相同的结构域,而LvE75-3仅包含LBD结构域,与果蝇E75D相同。在凡纳滨对虾蜕皮过程中,LvE75-1/2/3/4在D3～D4时期高表达,而LvE75-5和LvE75-6表达量很低。在成体组织中,LvE75各种剪切形式在所有检测的组织中均有表达,且在表皮、肠和鳃中表达较高,在肝胰脏、血细胞和淋巴组织中仅LvE75-3表达较高。实验通过双链RNA干扰LvE75基因的表达,在干扰样品中,检测到Halloween基因中的spo、phm和dib表达下调,shd表达上调,表明LvE75可能通过调控Halloween基因的表达来影响蜕皮激素的合成;同时E75基因的干扰也使同为蜕皮激素早期应答基因的Br-C基因和Ftz-F1基因表达下调,HR3基因表达上调,表明LvE75基因对蜕皮信号通路上下游基因均有作用。在LvE75基因持续干扰12 d后,凡纳滨对虾的蜕皮率显著低于对照组,而死亡率显著高于对照组,说明LvE75基因对凡纳滨对虾的蜕皮和生存具有重要作用。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金(31672632,31702320,41876167)~~ |
| 卷 | v.43期:04页:70-80 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1000-0615 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/188637]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 2.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 3.中国科学院大学 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 杜江丽,张晓军,张小溪,等. 凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析. 2019. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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