基于线粒体COI序列的DNA条形码在中国海口足类物种鉴定中的应用分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 沙忠利 ; 王永良; 程娇
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| 发表日期 | 2018-07-15 |
| 出处 | 中国水产科学
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| 关键词 | 口足类 COI基因 DNA条形码 物种鉴定 隐存种 |
| 英文摘要 | 中国海口足类动物区系具有丰富的物种多样性,是我国海洋底栖生物中的重要经济类群。口足类的属内种间鉴别特征有的极为相似,仅依靠传统的形态分类方法很难对近缘种和疑难种进行准确的鉴定。DNA条形码技术可以弥补传统形态学鉴定的某些局限,为物种鉴定提供了有效的工具。该研究探讨了利用线粒体COI序列对中国海口足类进行物种鉴定的可行性,共获得口足目4总科6科24属38个种的204条线粒体COI序列,与Gen Bank收录的14种42条口足类同源序列进行比对,结果显示口足类COI基因不存在碱基插入缺失现象,碱基组成偏倚明显,A+T含量(63.5%)显著高于G+C含量(36.5%)。基于Kimura双参数模型计算遗传距离,结果显示遗传距离随着分类阶元的增高而增大。同物种种内个体间的遗传距离变化范围在0%~3.91%,平均值为0.76%。同属内各物种间的遗传距离变化范围为6.55%~18.99%,平均值为12.91%。同科内不同属间的遗传距离变化范围为9.16%~23.32%,平均值为16.89%。不同科间的遗传距离变化范围为16.52%~26.6%,平均值为21.31%。由此可见,口足类COI基因的种间和种内遗传距离存在明显的间隙。基于COI序列构建的口足类邻接关系树显示所有包含大于1个个体的物种均可形成单系群,且节点支持率均为100%。本研究证明了COI序列作为DNA条形码标准基因在口足类物种鉴定中的有效性。此外,研究发现中国沿海分布的口虾蛄可能至少存在两个隐存种,实证了基于COI序列的DNA条形码技术能够用于口虾蛄隐存多样性的探究。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 科技部科技基础性工作专项(2013FY110700,2014FY110500) ; 国家自然科学基金项目(31401955) |
| 卷 | v.25期:04页:156-164 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1005-8737 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/188876]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院大学 3.中国科学院海洋大科学研究中心 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 沙忠利,王永良,程娇. 基于线粒体COI序列的DNA条形码在中国海口足类物种鉴定中的应用分析. 2018. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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