基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 张梅; 米铁柱; 甄毓; 王华龙 |
| 发表日期 | 2018-02-26 |
| 出处 | 中国海洋大学学报(自然科学版)
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| 关键词 | 玛氏骨条藻 脂肪酸合成 转录组 |
| 英文摘要 | 本研究利用Illumina Hiseq2000对不同生长时期的玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)进行转录组测序,得到的转录本通过NR、NT、Swiss-Prot和KOG数据库进行功能分类,通过GO和KEGG数据库进行相关代谢途径分析和基因差异表达分析,在此基础上构建了S.marinoi的脂肪酸生物合成途径,发现共存在26种酶和蛋白对应的33个编码基因,对这33个基因序列进行比对发现其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)的同源性较高。在该代谢通路中,S.marinoi在不同生长时期出现显著差异表达的基因有15个。与指数期相比,柠檬酸裂解酶和长链酰基-CoA合成酶(Comp14198_c0)的编码基因在稳定期和衰亡期出现显著下调表达,而柠檬酸合酶的编码基因仅在稳定期出现显著下调表达。与之相反的是,以乙酰-CoA羧化酶编码基因为代表的12个编码基因在稳定期和衰亡期均出现了显著上调。通过分析,初步推测S.marinoi在稳定期的脂肪酸合成能力高于指数期。这些信息为海洋微藻脂肪酸生物合成途径的研究提供了理论基础,有助于对S.marinoi进行基因改造,提高脂肪酸的合成量。同时,又能为赤潮的防治提供新的思路。 |
| DOI标识 | 10.16441/j.cnki.hdxb.20160383 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金项目(41521064) ; 山东省自然科学基金项目(ZR2014DM007) ; 鳌山科技创新计划项目(2016ASKJ02)资助~~ |
| 卷 | v.48;No.279期:04页:84-96 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | X173 |
| ISSN号 | 1672-5174 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/189010]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国海洋大学环境科学与工程学院 2.海洋环境与生态教育部重点实验室 3.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室 4.中国海洋大学海洋生命学院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张梅,米铁柱,甄毓,等. 基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析. 2018. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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