海洋沉积物中硫酸盐还原菌和硫氧化菌群落分析方法的比较
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 张玉 ; 米铁柱; 甄毓; 陈烨; 付璐璐; 王勋功
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| 发表日期 | 2017-08-23 |
| 出处 | 环境科学
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| 关键词 | 硫酸盐还原菌 硫氧化菌 高通量测序 克隆文库 沉积物 |
| 英文摘要 | 硫酸盐还原菌(sulfate-reducing prokaryotes,SRP)和硫氧化菌(sulfur-oxidizing prokaryotes,SOP)在硫的生物地球化学循环中发挥着极为重要的作用.本文以SRP作为高丰富度高多样性菌群代表,针对于SRP所共有的异化型亚硫酸盐还原酶(dissimilatory sulphite reductase,DSR)中的β亚基基因(dsr B),通过克隆文库技术、454高通量测序技术和Illumina高通量测序技术对其群落特征进行比较分析.结果表明,Illumina高通量测序技术优于454高通量测序技术和克隆文库技术,特别在低丰度物种的检测方面,Illumina高通量测序技术具有明显优势.以SOP soxB基因(~750 bp)作为较长基因片段的代表,分别采用454高通量测序技术和Illumina单端高通量测序技术对SOP群落组成和多样性信息进行比较分析,结果表明,454高通量测序技术在读长上的优势并未体现出来,而Illumina单端高通量测序技术优于454高通量测序技术. |
| DOI标识 | 10.13227/j.hjkx.201705054 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金项目(41521064,41620104001) ; 中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室项目 ; 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学开放基金项目(KLMEES201601) |
| 卷 | v.39期:01页:441-452 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | Q93 |
| ISSN号 | 0250-3301 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/189217]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国海洋大学环境科学与工程学院 2.海洋环境与生态教育部重点实验室 3.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室 4.中国海洋大学海洋生命学院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张玉,米铁柱,甄毓,等. 海洋沉积物中硫酸盐还原菌和硫氧化菌群落分析方法的比较. 2017. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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