凡纳滨对虾Hox基因及其在早期发育中表达模式的研究
文献类型:CNKI期刊论文
作者 | 孙晓晴![]() ![]() ![]() |
发表日期 | 2015-06-26 |
出处 | 中国海洋大学学报(自然科学版)
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关键词 | Hox基因 凡纳滨对虾 甲壳动物 早期发育 表达模式 |
英文摘要 | Hox基因是决定动物形态多样性的关键基因,同一类型Hox基因的同源异型结构域(Homeodomain)序列及其功能在进化上高度保守。甲壳动物是仅次于昆虫的第二大类节肢动物,但有关其Hox基因研究在深度和广度上都远远不如昆虫。本研究首先通过RNA-Seq测序技术和生物信息学方法分析发现在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)中存在13种Hox基因,分别为Lvlab、Lvpb、Lvhox3、Lvdfd、Lvscr、Lvftz、Lvantp、Lvubx、LvabdA、LvabdB、Lvmsx、Lvmnx和Lvdll;然后根据RNA-Seq数据,克隆获得了这13条基因的开放阅读框(ORF)的cDNA序列,并对其序列结构、早期发育表达模式及同源关系进行了初步分析。序列分析显示这些Hox基因的结构非常保守,同源比对显示同一类型的Hox基因的氨基酸序列在不同物种之间具有较高的保守性;表达模式分析结果发现,不同Hox基因在早期发育过程中的表达模式不同,从囊胚期开始,按时序表达的先后顺序基本为Lvmsx、Lvlab、Lvpb、Lvhox3、Lvdfd、Lvscr、Lvftz、Lvmnx、Lvdll、Lvantp、Lvubx、LvabdA、LvabdB。根据各Hox基因表达时期对应的对虾胚胎和幼体发育情况,初步推测了这些基因在凡纳滨对虾的发育过程中可能的功能。 |
DOI标识 | 10.16441/j.cnki.hdxb.20140323 |
文献子类 | CNKI期刊论文 |
资助机构 | 国家高技术研究发展计划项目(2012AA092205 ; 2012AA10A404) ; 国家自然科学基金项目(31172396 ; 31272683)资助 |
卷 | v.45;No.245期:08页:55-65 |
语种 | 中文; |
分类号 | S917.4 |
ISSN号 | 1672-5174 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/189997] ![]() |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 2.中国科学院大学 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 孙晓晴,隗健凯,袁剑波,等. 凡纳滨对虾Hox基因及其在早期发育中表达模式的研究. 2015. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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