斑马鱼GSTM单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 王倩 ; 尤锋; 辛梦娇; 胡金伟; 谭训刚
|
| 发表日期 | 2015-01-15 |
| 出处 | 海洋科学
 |
| 关键词 | 斑马鱼(Danio rerio) GSTM PCR-SSCP SNPs 低温耐受相关 |
| 英文摘要 | 为分析谷胱甘肽硫-转移酶M基因(glutathione S-transferases M,GSTM)与鱼类低温耐受性的相关性,本实验运用PCR-SSCP技术研究了130尾斑马鱼(Danio rerio)GSTM基因5?UTR、3?UTR和第一内含子序列的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs),同时分析了筛选到的基因型与其低温耐受性状的关联性。结果显示,在其5UTR区域检测到AB、BC、AC 3种基因型个体,共A、B、C 3个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度分别是1.000和0.570,多态信息含量为0.472,所检测群体在该座位偏离了Hardy-Weinberg平衡;第1内含子中检测到DD、DE和EE 3种基因型个体,共D、E两个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度分别为0.408和0.477,多态信息含量为0.362,群体在该座位符合Hardy-Weinberg平衡。3'UTR区域中没有发现多态性。上述2个SNP座位与斑马鱼低温耐受性状的关联分析结果表明,5'UTR区3种基因型与低温耐受性状均没有显著相关性(χ2=4.029,P>0.05)。而第1内含子3种基因型与低温耐受性状显著相关(χ2=8.498,P<0.05):DD基因型在耐低温群体中占优势(50.00%),并表现为对受低温胁迫斑马鱼的保护性因素(OR=0.520,95%CI=0.255–1.061),而DE基因型在不耐低温群体中占优势(51.31%),表现为低温胁迫下斑马鱼的危险因素(OR=3.012,95%CI=1.413–6.419)。研究结果为GSTM基因SNPs位点与斑马鱼低温耐受性能关联分析提供了依据,也将为海水经济鱼类抗寒标记筛选育种提供参考。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家973计划资助项目(2010CB126304) ; 国家863计划资助项目(2012AA10A408,2012AA092203) ; 国家科技基础条件平台建设运行项目-水产种质资源平台运行服务(2006DKA30470017) |
| 卷 | v.39;No.307期:01页:3-9 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1000-3096 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190181]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院大学 2.中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王倩,尤锋,辛梦娇,等. 斑马鱼GSTM单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析. 2015. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。