淡水枝角水蚤(Daphnia pulex)微小RNA(miRNA)的生物信息学发掘与分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 柳承璋; 李富花; 相建海
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| 发表日期 | 2013-07-15 |
| 出处 | 海洋与湖沼
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| 关键词 | 淡水枝角水蚤 甲壳动物 microRNA miRNA 微小RNA 生物信息学 |
| 英文摘要 | 微小RNA(microRNA或miRNA),是广泛存在于多细胞生物及其病毒的一类由22个左右核苷酸组成的内源性非编码RNA,具有转录后水平上的基因表达调控功能。本文在淡水枝角水蚤的全基因组序列的基础上,通过生物信息学方法对淡水枝角水蚤(Daphnia pulex)miRNA进行了发掘,得到miRNA前体(pre-miRNA)252个、可编码262个功能miRNA;发现了6个miRNA簇。8号染色体miRNA的出现频率显著高于其他染色体,而4号染色体miRNA频率明显显著较低。通过与几种两侧对称动物的聚类分析将pre-miRNA归为191个miRNA家族,其中105个家族为淡水枝角水蚤所特有,15个家族为节肢动物门特有。在几种两侧对称动物中,淡水枝角水蚤的miRNA与果蝇最为相似。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金重大项目,30730071号 ; 国家863项目,2012AA10A404号,2012AA092205号 |
| 卷 | v.44期:04页:25-33 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | Q522 |
| ISSN号 | 0029-814X |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190818]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院大学 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 柳承璋,李富花,相建海. 淡水枝角水蚤(Daphnia pulex)微小RNA(miRNA)的生物信息学发掘与分析. 2013. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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