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成团泛菌依赖型磷酸甘油酸变位酶基因的克隆、序列分析及产氢中的差异表达

文献类型:CNKI期刊论文

作者马颖超; 朱大玲; 王广策
发表日期2013-06-15
出处海洋科学
关键词成团泛菌(Pantoea agglomerans) 依赖型磷酸甘油酸变位酶 基因克隆 序列分析 产氢
英文摘要为研究高效产氢菌株成团泛菌(Pantoea agglomerans)BH-18中依赖型磷酸甘油酸变位酶(cofactor-dependent phosphoglycerate mutase,dPGM)与产氢之间的关系,本研究根据GenBank上已登录的肠杆菌中编码dPGM的基因序列设计一对引物,从细菌基因组DNA中克隆得到编码dPGM基因的完整开放阅读框,其长度为753 bp,编码250 aa。采用BLAST对其与NCBI GenBank中的核苷酸序列进行比较分析,结果表明该基因保守性相对较高,与肠杆菌科众多菌株中的dPGM基因相似性达100%。采用Bioedit和Mega4软件构建NJ系统进化树,结果表明成团泛菌BH-18的dPGM氨基酸序列与Enterobacter asburiae的dPGM聚为一类,而与成团泛菌属中其他菌株的该蛋白关系较远,dPGM的氨基酸序列在属内不保守。最后,根据已获得的基因序列设计引物,采用RT-PCR的方法分析了成团泛菌BH-18产氢过程中dPGM基因的转录情况,结果表明dPGM基因的转录与产氢呈正相关,依赖型磷酸甘油酸变位酶是产氢过程中的关键酶。
文献子类CNKI期刊论文
资助机构国家自然科学基金项目(40906074) ; 天津市自然科学基金项目(12JCQNJC04300,12JCZDJC22200,12JCQNJC04200) ; 天津科技大学科学基金项目(20100410)
v.37;No.288期:06页:62-67
语种中文;
分类号Q936;Q78
ISSN号1000-3096
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190850]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.天津科技大学海洋科学与工程学院天津市海洋资源与化学重点实验室
2.中国科学院海洋研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
马颖超,朱大玲,王广策. 成团泛菌依赖型磷酸甘油酸变位酶基因的克隆、序列分析及产氢中的差异表达. 2013.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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