逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 李娟; 李莉; 张国范 |
| 发表日期 | 2013-02-15 |
| 出处 | 海洋科学
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| 关键词 | 海湾扇贝(Argopectenirradians) 过氧化物还原酶V 内含子 逆转座子 非长末端重复元件 |
| 英文摘要 | 根据海湾扇贝(Argopecten irradians)过氧化物还原酶V(AiPrxV)的cDNA序列和部分基因组DNA序列设计引物,采用基因组步移方法扩增获得其第1内含子(I1)完整序列,并通过Blast比对、DNAMAN和RepFind搜索进行序列分析。AiPrxV I1长8 565bp,占AiPrxV基因全长的68%,AT%显著高于GC%。在5 900-6 700bp的区域中包含了不完整的编码区,经分析与文昌鱼、海胆的逆转录酶有极高的相似性,其N端与多种动植物逆转座子的逆转录酶C端具有相似特征。此外,发现AiPrxV I1中包含283个重复序列,在3 500-4 000bp和6 800-7 200bp区域尤为密集。以上特点提示海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子可能是由一个非长末端重复元件逆转座子(non-LTR retrotransposons)插入,逐渐演变而形成的。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家公益性行业(农业)科研专项(3-35) ; 国家自然科学基金项目(30800842) ; 国家高技术研究发展计划项目(863计划,2010AA10A401) |
| 卷 | v.37;No.284期:02页:3-8 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1000-3096 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190981]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院研究生院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李娟,李莉,张国范. 逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子分析. 2013. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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