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星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较

文献类型:CNKI期刊论文

作者申欣
发表日期2012-09-15
出处水产科学
关键词星虫动物 线粒体基因组 基因排列 分子标记
英文摘要综合利用通用引物PCR和长PCR扩增,获得可口革囊星虫的线粒体DNA,结合鸟枪法和引物步移法获得可口革囊星虫的线粒体基因组。比较可口革囊星虫与方格星虫线粒体基因组,所有的37个基因均在同一条链上编码。2个星虫动物线粒体基因组蛋白质编码基因的起始、终止密码子及氨基酸长度存在差异。2个星虫动物的线粒体基因组,存在6个保守的基因区块:(1)nad6-cob-P-S2-C-M,(2)I-K-nad3-F,(3)nad4L-nad4-L2,(4)nad1-W-atp6,(5)nad5-S1及(6)nad2-cox1。去除转运RNA而仅比较蛋白质编码基因和核糖体RNA,则2个星虫动物线粒体基因组主编码基因的基因排列完全一致,均为:cox1-cox2-atp8-cox3-nad6-cob-srRNA-lrRNA-nad3-nad4L-nad4-nad1-atp6-nad5-nad2。星虫动物、环节动物和螠虫动物线粒体基因组共有5个保守区块:(1)cox1-cox2-atp8,(2)nad4L-nad4,(3)srRNA-lrRNA,(4)cox3-nad6-cob,(5)atp6-nad5。在15个主编码基因中,nad5基因和nad4基因变异位点数最多,因此可作为备选的分子标记,用于分析星虫动物不同物种和群体之间的生物多样性。
DOI标识10.16378/j.cnki.1003-1111.2012.09.001
文献子类CNKI期刊论文
资助机构江苏省“青蓝工程”人才基金资助项目(苏教师[2010]27号) ; 江苏省海洋生物技术重点实验室基金资助项目(2009HS13) ; 淮海工学院自然科学基金资助项目(Z2009048)
v.31期:09页:48-53
语种中文;
分类号Q951
ISSN号1003-1111
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191152]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.淮海工学院海洋学院
2.中国科学院海洋研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
申欣. 星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较. 2012.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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