日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 申欣; 李晓; 沙忠利 ; 阎斌伦; 徐启华
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| 发表日期 | 2012-07-20 |
| 出处 | 中国科学:生命科学
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| 关键词 | 十足目 真虾下目 线粒体基因组 基因排列 系统发育 |
| 英文摘要 | 在日本鼓虾线粒体基因组完成的基础上,结合现有线粒体基因组数据,全面揭示了真虾类线粒体基因组的基本特征.日本鼓虾线粒体基因组全长16487bp,包含37个基因,与后生动物线粒体基因组的标准基因组成一致.4个已完成的真虾类(罗氏沼虾、日本沼虾、沼虾Macrobrachium lanchesteri和夏威夷红虾)线粒体基因组的基因排列与泛甲壳动物的原始排列完全相同,过去曾经认为在真虾下目线粒体基因组中没有基因重排现象.然而,鼓虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnE)的易位和反转,这种基因排列方式在其他甲壳动物线粒体基因组中未见报道.同时,脊尾白虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnP或trnT)的易位.分别统计了2种鼓虾(日本鼓虾和鲜明鼓虾)和3种沼虾(罗氏沼虾、日本沼虾和沼虾M.lanchesteri)13个蛋白质编码基因(PCGs)非同义替换与同义替换的比值(Ka/Ks),发现鼓虾和沼虾所有线粒体蛋白质编码基因的Ka/Ks均小于1,显示出强烈的纯化选择.基于线粒体基因组的系统发育分析结果,强烈支持长臂虾科和鼓虾科为单系群,并且其在科级的亲缘关系为:(长臂虾科+鼓虾科)+匙指虾科(BPM=100,BPP=100). |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金(批准号:40906067和31172054) ; 中央财政支持地方高校发展专项基金(CXTD04) ; 中国博士后科学基金(批准号:2012M510054) ; 江苏省海洋生物技术重点实验室基金(批准号:2009HS12和2009HS13) ; 青蓝工程人才基金(批准号:苏教师[2010]27)资助项目 |
| 卷 | v.42期:07页:83-90 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1674-7232 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191178]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室 2.中国科学院海洋研究所 3.山东省花生研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 申欣,李晓,沙忠利,等. 日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育. 2012. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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